Protein–RNA interactions for Protein: A7M7C7

Skor2, SKI family transcriptional corepressor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,008 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skor2A7M7C7 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Skor2A7M7C7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Skor2A7M7C7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Skor2A7M7C7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Skor2A7M7C7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Skor2A7M7C7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Skor2A7M7C7 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Skor2A7M7C7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Skor2A7M7C7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Skor2A7M7C7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Skor2A7M7C7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Skor2A7M7C7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Skor2A7M7C7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Skor2A7M7C7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Skor2A7M7C7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Skor2A7M7C7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Skor2A7M7C7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Skor2A7M7C7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Skor2A7M7C7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Skor2A7M7C7 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Skor2A7M7C7 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Skor2A7M7C7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Skor2A7M7C7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Skor2A7M7C7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Skor2A7M7C7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Skor2A7M7C7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Skor2A7M7C7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Skor2A7M7C7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Skor2A7M7C7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Skor2A7M7C7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Skor2A7M7C7 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Skor2A7M7C7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Skor2A7M7C7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Skor2A7M7C7 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Skor2A7M7C7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Skor2A7M7C7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Skor2A7M7C7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Skor2A7M7C7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Skor2A7M7C7 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Skor2A7M7C7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Skor2A7M7C7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Skor2A7M7C7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Skor2A7M7C7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Skor2A7M7C7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Skor2A7M7C7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Skor2A7M7C7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Skor2A7M7C7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Skor2A7M7C7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Skor2A7M7C7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Skor2A7M7C7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Skor2A7M7C7 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Skor2A7M7C7 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Skor2A7M7C7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Skor2A7M7C7 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Skor2A7M7C7 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Skor2A7M7C7 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Skor2A7M7C7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Skor2A7M7C7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Skor2A7M7C7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Skor2A7M7C7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Skor2A7M7C7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Skor2A7M7C7 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Skor2A7M7C7 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Skor2A7M7C7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Skor2A7M7C7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Skor2A7M7C7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Skor2A7M7C7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Skor2A7M7C7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Skor2A7M7C7 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Skor2A7M7C7 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Skor2A7M7C7 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Skor2A7M7C7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Skor2A7M7C7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Skor2A7M7C7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Skor2A7M7C7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Skor2A7M7C7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Skor2A7M7C7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Skor2A7M7C7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Skor2A7M7C7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Skor2A7M7C7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Skor2A7M7C7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Skor2A7M7C7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Skor2A7M7C7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Skor2A7M7C7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Skor2A7M7C7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Skor2A7M7C7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Skor2A7M7C7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Skor2A7M7C7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Skor2A7M7C7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Skor2A7M7C7 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Skor2A7M7C7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Skor2A7M7C7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Skor2A7M7C7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Skor2A7M7C7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Skor2A7M7C7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Skor2A7M7C7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Skor2A7M7C7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Skor2A7M7C7 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Skor2A7M7C7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Skor2A7M7C7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.5 ms