Protein–RNA interactions for Protein: A6X8Z9

4930435E12Rik, RIKEN cDNA 4930435E12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930435E12RikA6X8Z9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930435E12RikA6X8Z9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930435E12RikA6X8Z9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930435E12RikA6X8Z9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930435E12RikA6X8Z9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930435E12RikA6X8Z9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930435E12RikA6X8Z9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
4930435E12RikA6X8Z9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930435E12RikA6X8Z9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930435E12RikA6X8Z9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms