Protein–RNA interactions for Protein: A3KMP2

Ttc38, Tetratricopeptide repeat protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc38A3KMP2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ttc38A3KMP2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ttc38A3KMP2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ttc38A3KMP2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ttc38A3KMP2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ttc38A3KMP2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ttc38A3KMP2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ttc38A3KMP2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ttc38A3KMP2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ttc38A3KMP2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ttc38A3KMP2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ttc38A3KMP2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ttc38A3KMP2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ttc38A3KMP2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ttc38A3KMP2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ttc38A3KMP2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ttc38A3KMP2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ttc38A3KMP2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ttc38A3KMP2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ttc38A3KMP2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ttc38A3KMP2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ttc38A3KMP2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttc38A3KMP2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttc38A3KMP2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttc38A3KMP2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttc38A3KMP2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttc38A3KMP2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttc38A3KMP2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttc38A3KMP2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttc38A3KMP2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttc38A3KMP2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttc38A3KMP2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttc38A3KMP2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttc38A3KMP2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttc38A3KMP2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ttc38A3KMP2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ttc38A3KMP2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ttc38A3KMP2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ttc38A3KMP2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ttc38A3KMP2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ttc38A3KMP2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ttc38A3KMP2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ttc38A3KMP2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ttc38A3KMP2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ttc38A3KMP2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ttc38A3KMP2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ttc38A3KMP2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ttc38A3KMP2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ttc38A3KMP2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ttc38A3KMP2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ttc38A3KMP2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ttc38A3KMP2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ttc38A3KMP2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ttc38A3KMP2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ttc38A3KMP2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ttc38A3KMP2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ttc38A3KMP2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ttc38A3KMP2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ttc38A3KMP2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ttc38A3KMP2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ttc38A3KMP2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ttc38A3KMP2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ttc38A3KMP2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ttc38A3KMP2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ttc38A3KMP2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ttc38A3KMP2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ttc38A3KMP2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ttc38A3KMP2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ttc38A3KMP2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ttc38A3KMP2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ttc38A3KMP2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ttc38A3KMP2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ttc38A3KMP2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ttc38A3KMP2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ttc38A3KMP2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ttc38A3KMP2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ttc38A3KMP2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ttc38A3KMP2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ttc38A3KMP2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ttc38A3KMP2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ttc38A3KMP2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ttc38A3KMP2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ttc38A3KMP2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ttc38A3KMP2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ttc38A3KMP2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ttc38A3KMP2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ttc38A3KMP2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ttc38A3KMP2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ttc38A3KMP2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ttc38A3KMP2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ttc38A3KMP2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ttc38A3KMP2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ttc38A3KMP2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ttc38A3KMP2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ttc38A3KMP2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ttc38A3KMP2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ttc38A3KMP2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ttc38A3KMP2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ttc38A3KMP2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ttc38A3KMP2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms