Protein–RNA interactions for Protein: A3KMN5

Prr16, Protein Largen, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr16A3KMN5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prr16A3KMN5 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prr16A3KMN5 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prr16A3KMN5 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prr16A3KMN5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prr16A3KMN5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Prr16A3KMN5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prr16A3KMN5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prr16A3KMN5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prr16A3KMN5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prr16A3KMN5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prr16A3KMN5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prr16A3KMN5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prr16A3KMN5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prr16A3KMN5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prr16A3KMN5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prr16A3KMN5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prr16A3KMN5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prr16A3KMN5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prr16A3KMN5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prr16A3KMN5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prr16A3KMN5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prr16A3KMN5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prr16A3KMN5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prr16A3KMN5 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prr16A3KMN5 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prr16A3KMN5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prr16A3KMN5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prr16A3KMN5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prr16A3KMN5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prr16A3KMN5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prr16A3KMN5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prr16A3KMN5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Prr16A3KMN5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Prr16A3KMN5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prr16A3KMN5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prr16A3KMN5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prr16A3KMN5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prr16A3KMN5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prr16A3KMN5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prr16A3KMN5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prr16A3KMN5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prr16A3KMN5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prr16A3KMN5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prr16A3KMN5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prr16A3KMN5 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prr16A3KMN5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prr16A3KMN5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prr16A3KMN5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prr16A3KMN5 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prr16A3KMN5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prr16A3KMN5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prr16A3KMN5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prr16A3KMN5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prr16A3KMN5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prr16A3KMN5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prr16A3KMN5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Prr16A3KMN5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Prr16A3KMN5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Prr16A3KMN5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Prr16A3KMN5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prr16A3KMN5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prr16A3KMN5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prr16A3KMN5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prr16A3KMN5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prr16A3KMN5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prr16A3KMN5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prr16A3KMN5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prr16A3KMN5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prr16A3KMN5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prr16A3KMN5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Prr16A3KMN5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Prr16A3KMN5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prr16A3KMN5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prr16A3KMN5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prr16A3KMN5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prr16A3KMN5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prr16A3KMN5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prr16A3KMN5 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prr16A3KMN5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prr16A3KMN5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prr16A3KMN5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prr16A3KMN5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prr16A3KMN5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prr16A3KMN5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prr16A3KMN5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prr16A3KMN5 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prr16A3KMN5 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prr16A3KMN5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prr16A3KMN5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prr16A3KMN5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Prr16A3KMN5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prr16A3KMN5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prr16A3KMN5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prr16A3KMN5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prr16A3KMN5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prr16A3KMN5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prr16A3KMN5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prr16A3KMN5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prr16A3KMN5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms