Protein–RNA interactions for Protein: A2ASJ1

Pramef17, PRAME family member 17, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef17A2ASJ1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pramef17A2ASJ1 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pramef17A2ASJ1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pramef17A2ASJ1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pramef17A2ASJ1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pramef17A2ASJ1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pramef17A2ASJ1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pramef17A2ASJ1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pramef17A2ASJ1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pramef17A2ASJ1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pramef17A2ASJ1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Pramef17A2ASJ1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pramef17A2ASJ1 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Pramef17A2ASJ1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pramef17A2ASJ1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pramef17A2ASJ1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pramef17A2ASJ1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pramef17A2ASJ1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pramef17A2ASJ1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pramef17A2ASJ1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pramef17A2ASJ1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pramef17A2ASJ1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pramef17A2ASJ1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pramef17A2ASJ1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pramef17A2ASJ1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pramef17A2ASJ1 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pramef17A2ASJ1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pramef17A2ASJ1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pramef17A2ASJ1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pramef17A2ASJ1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pramef17A2ASJ1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pramef17A2ASJ1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pramef17A2ASJ1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Pramef17A2ASJ1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pramef17A2ASJ1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pramef17A2ASJ1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pramef17A2ASJ1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pramef17A2ASJ1 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pramef17A2ASJ1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pramef17A2ASJ1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pramef17A2ASJ1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pramef17A2ASJ1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Pramef17A2ASJ1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pramef17A2ASJ1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pramef17A2ASJ1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pramef17A2ASJ1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pramef17A2ASJ1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pramef17A2ASJ1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pramef17A2ASJ1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Pramef17A2ASJ1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Pramef17A2ASJ1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pramef17A2ASJ1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pramef17A2ASJ1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pramef17A2ASJ1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pramef17A2ASJ1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pramef17A2ASJ1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pramef17A2ASJ1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pramef17A2ASJ1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pramef17A2ASJ1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pramef17A2ASJ1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Pramef17A2ASJ1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Pramef17A2ASJ1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pramef17A2ASJ1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pramef17A2ASJ1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pramef17A2ASJ1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pramef17A2ASJ1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pramef17A2ASJ1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pramef17A2ASJ1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pramef17A2ASJ1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pramef17A2ASJ1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Pramef17A2ASJ1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pramef17A2ASJ1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pramef17A2ASJ1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pramef17A2ASJ1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pramef17A2ASJ1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pramef17A2ASJ1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pramef17A2ASJ1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pramef17A2ASJ1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pramef17A2ASJ1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pramef17A2ASJ1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pramef17A2ASJ1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pramef17A2ASJ1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pramef17A2ASJ1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Pramef17A2ASJ1 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Pramef17A2ASJ1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pramef17A2ASJ1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Pramef17A2ASJ1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pramef17A2ASJ1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pramef17A2ASJ1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pramef17A2ASJ1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pramef17A2ASJ1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pramef17A2ASJ1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pramef17A2ASJ1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pramef17A2ASJ1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pramef17A2ASJ1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pramef17A2ASJ1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pramef17A2ASJ1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pramef17A2ASJ1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pramef17A2ASJ1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pramef17A2ASJ1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms