Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rtf1A2AQ19 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rtf1A2AQ19 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rtf1A2AQ19 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rtf1A2AQ19 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rtf1A2AQ19 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rtf1A2AQ19 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rtf1A2AQ19 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Rtf1A2AQ19 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rtf1A2AQ19 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rtf1A2AQ19 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rtf1A2AQ19 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Rtf1A2AQ19 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rtf1A2AQ19 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rtf1A2AQ19 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Rtf1A2AQ19 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rtf1A2AQ19 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rtf1A2AQ19 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rtf1A2AQ19 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rtf1A2AQ19 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rtf1A2AQ19 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rtf1A2AQ19 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rtf1A2AQ19 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rtf1A2AQ19 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rtf1A2AQ19 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rtf1A2AQ19 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rtf1A2AQ19 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rtf1A2AQ19 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rtf1A2AQ19 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rtf1A2AQ19 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rtf1A2AQ19 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rtf1A2AQ19 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rtf1A2AQ19 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rtf1A2AQ19 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rtf1A2AQ19 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rtf1A2AQ19 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rtf1A2AQ19 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rtf1A2AQ19 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rtf1A2AQ19 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rtf1A2AQ19 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rtf1A2AQ19 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rtf1A2AQ19 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rtf1A2AQ19 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rtf1A2AQ19 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rtf1A2AQ19 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rtf1A2AQ19 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rtf1A2AQ19 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rtf1A2AQ19 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rtf1A2AQ19 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rtf1A2AQ19 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rtf1A2AQ19 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rtf1A2AQ19 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rtf1A2AQ19 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rtf1A2AQ19 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rtf1A2AQ19 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rtf1A2AQ19 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rtf1A2AQ19 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rtf1A2AQ19 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rtf1A2AQ19 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC26.01■■□□□ 1.76
Rtf1A2AQ19 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rtf1A2AQ19 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Rtf1A2AQ19 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rtf1A2AQ19 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rtf1A2AQ19 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rtf1A2AQ19 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rtf1A2AQ19 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rtf1A2AQ19 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rtf1A2AQ19 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rtf1A2AQ19 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rtf1A2AQ19 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rtf1A2AQ19 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rtf1A2AQ19 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rtf1A2AQ19 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rtf1A2AQ19 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rtf1A2AQ19 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rtf1A2AQ19 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Rtf1A2AQ19 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC26■■□□□ 1.75
Rtf1A2AQ19 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rtf1A2AQ19 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Rtf1A2AQ19 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rtf1A2AQ19 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rtf1A2AQ19 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rtf1A2AQ19 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rtf1A2AQ19 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rtf1A2AQ19 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rtf1A2AQ19 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rtf1A2AQ19 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rtf1A2AQ19 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rtf1A2AQ19 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rtf1A2AQ19 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rtf1A2AQ19 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rtf1A2AQ19 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Rtf1A2AQ19 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rtf1A2AQ19 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rtf1A2AQ19 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rtf1A2AQ19 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rtf1A2AQ19 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rtf1A2AQ19 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rtf1A2AQ19 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rtf1A2AQ19 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.9 ms