Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtcflA2APF3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtcflA2APF3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtcflA2APF3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtcflA2APF3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtcflA2APF3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtcflA2APF3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtcflA2APF3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtcflA2APF3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtcflA2APF3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtcflA2APF3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtcflA2APF3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtcflA2APF3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtcflA2APF3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtcflA2APF3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtcflA2APF3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtcflA2APF3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtcflA2APF3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CtcflA2APF3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CtcflA2APF3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CtcflA2APF3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CtcflA2APF3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CtcflA2APF3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CtcflA2APF3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CtcflA2APF3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CtcflA2APF3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CtcflA2APF3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CtcflA2APF3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CtcflA2APF3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CtcflA2APF3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CtcflA2APF3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CtcflA2APF3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CtcflA2APF3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CtcflA2APF3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CtcflA2APF3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CtcflA2APF3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CtcflA2APF3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CtcflA2APF3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CtcflA2APF3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CtcflA2APF3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CtcflA2APF3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CtcflA2APF3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CtcflA2APF3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CtcflA2APF3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CtcflA2APF3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CtcflA2APF3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CtcflA2APF3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CtcflA2APF3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CtcflA2APF3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CtcflA2APF3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CtcflA2APF3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CtcflA2APF3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CtcflA2APF3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CtcflA2APF3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CtcflA2APF3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CtcflA2APF3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CtcflA2APF3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CtcflA2APF3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CtcflA2APF3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CtcflA2APF3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CtcflA2APF3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CtcflA2APF3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CtcflA2APF3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CtcflA2APF3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CtcflA2APF3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CtcflA2APF3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CtcflA2APF3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CtcflA2APF3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CtcflA2APF3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CtcflA2APF3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CtcflA2APF3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CtcflA2APF3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CtcflA2APF3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CtcflA2APF3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CtcflA2APF3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CtcflA2APF3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CtcflA2APF3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CtcflA2APF3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CtcflA2APF3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CtcflA2APF3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CtcflA2APF3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CtcflA2APF3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CtcflA2APF3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CtcflA2APF3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CtcflA2APF3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CtcflA2APF3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CtcflA2APF3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CtcflA2APF3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CtcflA2APF3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CtcflA2APF3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CtcflA2APF3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CtcflA2APF3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CtcflA2APF3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CtcflA2APF3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CtcflA2APF3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CtcflA2APF3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CtcflA2APF3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CtcflA2APF3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CtcflA2APF3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CtcflA2APF3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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