Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Syndig1A2ANU3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Syndig1A2ANU3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Syndig1A2ANU3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Syndig1A2ANU3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Syndig1A2ANU3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Syndig1A2ANU3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Syndig1A2ANU3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Syndig1A2ANU3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Syndig1A2ANU3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Syndig1A2ANU3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Syndig1A2ANU3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Syndig1A2ANU3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Syndig1A2ANU3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Syndig1A2ANU3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Syndig1A2ANU3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Syndig1A2ANU3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Syndig1A2ANU3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Syndig1A2ANU3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Syndig1A2ANU3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Syndig1A2ANU3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Syndig1A2ANU3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Syndig1A2ANU3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Syndig1A2ANU3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Syndig1A2ANU3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Syndig1A2ANU3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Syndig1A2ANU3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Syndig1A2ANU3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Syndig1A2ANU3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Syndig1A2ANU3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Syndig1A2ANU3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Syndig1A2ANU3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Syndig1A2ANU3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Syndig1A2ANU3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Syndig1A2ANU3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Syndig1A2ANU3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Syndig1A2ANU3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Syndig1A2ANU3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Syndig1A2ANU3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Syndig1A2ANU3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Syndig1A2ANU3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Syndig1A2ANU3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Syndig1A2ANU3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Syndig1A2ANU3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Syndig1A2ANU3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Syndig1A2ANU3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Syndig1A2ANU3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Syndig1A2ANU3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Syndig1A2ANU3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Syndig1A2ANU3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Syndig1A2ANU3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Syndig1A2ANU3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Syndig1A2ANU3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Syndig1A2ANU3 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Syndig1A2ANU3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Syndig1A2ANU3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Syndig1A2ANU3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Syndig1A2ANU3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Syndig1A2ANU3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Syndig1A2ANU3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Syndig1A2ANU3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Syndig1A2ANU3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Syndig1A2ANU3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Syndig1A2ANU3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Syndig1A2ANU3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Syndig1A2ANU3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Syndig1A2ANU3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Syndig1A2ANU3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Syndig1A2ANU3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Syndig1A2ANU3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Syndig1A2ANU3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Syndig1A2ANU3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Syndig1A2ANU3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Syndig1A2ANU3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Syndig1A2ANU3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Syndig1A2ANU3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Syndig1A2ANU3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Syndig1A2ANU3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Syndig1A2ANU3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Syndig1A2ANU3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Syndig1A2ANU3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Syndig1A2ANU3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Syndig1A2ANU3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Syndig1A2ANU3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Syndig1A2ANU3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Syndig1A2ANU3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Syndig1A2ANU3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Syndig1A2ANU3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Syndig1A2ANU3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Syndig1A2ANU3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Syndig1A2ANU3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Syndig1A2ANU3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Syndig1A2ANU3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Syndig1A2ANU3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Syndig1A2ANU3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Syndig1A2ANU3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Syndig1A2ANU3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Syndig1A2ANU3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Syndig1A2ANU3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Syndig1A2ANU3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms