Protein–RNA interactions for Protein: A2ALS5

Rap1gap, Rap1 GTPase-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rap1gapA2ALS5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rap1gapA2ALS5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rap1gapA2ALS5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rap1gapA2ALS5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rap1gapA2ALS5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rap1gapA2ALS5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rap1gapA2ALS5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rap1gapA2ALS5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rap1gapA2ALS5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rap1gapA2ALS5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rap1gapA2ALS5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rap1gapA2ALS5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rap1gapA2ALS5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rap1gapA2ALS5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rap1gapA2ALS5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rap1gapA2ALS5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rap1gapA2ALS5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rap1gapA2ALS5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rap1gapA2ALS5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rap1gapA2ALS5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rap1gapA2ALS5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rap1gapA2ALS5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rap1gapA2ALS5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rap1gapA2ALS5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rap1gapA2ALS5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rap1gapA2ALS5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rap1gapA2ALS5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rap1gapA2ALS5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rap1gapA2ALS5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rap1gapA2ALS5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rap1gapA2ALS5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Rap1gapA2ALS5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Rap1gapA2ALS5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rap1gapA2ALS5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rap1gapA2ALS5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rap1gapA2ALS5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rap1gapA2ALS5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rap1gapA2ALS5 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rap1gapA2ALS5 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rap1gapA2ALS5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rap1gapA2ALS5 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Rap1gapA2ALS5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rap1gapA2ALS5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rap1gapA2ALS5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rap1gapA2ALS5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rap1gapA2ALS5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rap1gapA2ALS5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rap1gapA2ALS5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rap1gapA2ALS5 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Rap1gapA2ALS5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rap1gapA2ALS5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Rap1gapA2ALS5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Rap1gapA2ALS5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rap1gapA2ALS5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Rap1gapA2ALS5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rap1gapA2ALS5 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Rap1gapA2ALS5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rap1gapA2ALS5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rap1gapA2ALS5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rap1gapA2ALS5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rap1gapA2ALS5 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rap1gapA2ALS5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rap1gapA2ALS5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rap1gapA2ALS5 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Rap1gapA2ALS5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rap1gapA2ALS5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rap1gapA2ALS5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rap1gapA2ALS5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rap1gapA2ALS5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rap1gapA2ALS5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rap1gapA2ALS5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rap1gapA2ALS5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rap1gapA2ALS5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rap1gapA2ALS5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rap1gapA2ALS5 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Rap1gapA2ALS5 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Rap1gapA2ALS5 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Rap1gapA2ALS5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Rap1gapA2ALS5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rap1gapA2ALS5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rap1gapA2ALS5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rap1gapA2ALS5 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rap1gapA2ALS5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Rap1gapA2ALS5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rap1gapA2ALS5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rap1gapA2ALS5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rap1gapA2ALS5 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rap1gapA2ALS5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Rap1gapA2ALS5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rap1gapA2ALS5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rap1gapA2ALS5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Rap1gapA2ALS5 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rap1gapA2ALS5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rap1gapA2ALS5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rap1gapA2ALS5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rap1gapA2ALS5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Rap1gapA2ALS5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Rap1gapA2ALS5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rap1gapA2ALS5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rap1gapA2ALS5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 746 ms