Protein–RNA interactions for Protein: A2AF53

Tmem185a, Transmembrane protein 185A, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem185aA2AF53 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmem185aA2AF53 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmem185aA2AF53 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmem185aA2AF53 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmem185aA2AF53 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmem185aA2AF53 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmem185aA2AF53 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmem185aA2AF53 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmem185aA2AF53 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmem185aA2AF53 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmem185aA2AF53 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmem185aA2AF53 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmem185aA2AF53 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmem185aA2AF53 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmem185aA2AF53 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmem185aA2AF53 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmem185aA2AF53 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmem185aA2AF53 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmem185aA2AF53 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmem185aA2AF53 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmem185aA2AF53 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmem185aA2AF53 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmem185aA2AF53 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmem185aA2AF53 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmem185aA2AF53 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmem185aA2AF53 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmem185aA2AF53 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmem185aA2AF53 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmem185aA2AF53 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmem185aA2AF53 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmem185aA2AF53 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmem185aA2AF53 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmem185aA2AF53 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmem185aA2AF53 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmem185aA2AF53 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmem185aA2AF53 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmem185aA2AF53 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Tmem185aA2AF53 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Tmem185aA2AF53 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmem185aA2AF53 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmem185aA2AF53 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmem185aA2AF53 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmem185aA2AF53 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmem185aA2AF53 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmem185aA2AF53 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmem185aA2AF53 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmem185aA2AF53 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmem185aA2AF53 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmem185aA2AF53 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmem185aA2AF53 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmem185aA2AF53 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmem185aA2AF53 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmem185aA2AF53 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmem185aA2AF53 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmem185aA2AF53 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmem185aA2AF53 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmem185aA2AF53 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmem185aA2AF53 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmem185aA2AF53 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmem185aA2AF53 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmem185aA2AF53 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmem185aA2AF53 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmem185aA2AF53 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmem185aA2AF53 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmem185aA2AF53 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmem185aA2AF53 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmem185aA2AF53 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmem185aA2AF53 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmem185aA2AF53 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem185aA2AF53 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem185aA2AF53 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem185aA2AF53 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem185aA2AF53 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem185aA2AF53 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem185aA2AF53 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem185aA2AF53 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem185aA2AF53 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem185aA2AF53 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem185aA2AF53 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem185aA2AF53 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem185aA2AF53 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem185aA2AF53 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem185aA2AF53 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem185aA2AF53 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem185aA2AF53 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem185aA2AF53 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem185aA2AF53 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem185aA2AF53 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem185aA2AF53 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem185aA2AF53 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem185aA2AF53 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem185aA2AF53 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem185aA2AF53 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem185aA2AF53 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem185aA2AF53 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem185aA2AF53 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem185aA2AF53 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem185aA2AF53 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem185aA2AF53 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem185aA2AF53 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms