Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Itgb4A2A863 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Itgb4A2A863 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Itgb4A2A863 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Itgb4A2A863 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Itgb4A2A863 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Itgb4A2A863 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Itgb4A2A863 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Itgb4A2A863 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Itgb4A2A863 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Itgb4A2A863 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Itgb4A2A863 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Itgb4A2A863 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Itgb4A2A863 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Itgb4A2A863 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Itgb4A2A863 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Itgb4A2A863 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Itgb4A2A863 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Itgb4A2A863 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Itgb4A2A863 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Itgb4A2A863 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Itgb4A2A863 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Itgb4A2A863 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Itgb4A2A863 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Itgb4A2A863 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Itgb4A2A863 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Itgb4A2A863 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Itgb4A2A863 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Itgb4A2A863 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Itgb4A2A863 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Itgb4A2A863 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Itgb4A2A863 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Itgb4A2A863 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Itgb4A2A863 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Itgb4A2A863 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Itgb4A2A863 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Itgb4A2A863 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Itgb4A2A863 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Itgb4A2A863 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Itgb4A2A863 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Itgb4A2A863 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Itgb4A2A863 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Itgb4A2A863 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Itgb4A2A863 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Itgb4A2A863 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Itgb4A2A863 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Itgb4A2A863 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Itgb4A2A863 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Itgb4A2A863 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Itgb4A2A863 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Itgb4A2A863 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Itgb4A2A863 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Itgb4A2A863 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Itgb4A2A863 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Itgb4A2A863 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Itgb4A2A863 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Itgb4A2A863 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Itgb4A2A863 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Itgb4A2A863 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Itgb4A2A863 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Itgb4A2A863 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Itgb4A2A863 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Itgb4A2A863 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Itgb4A2A863 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Itgb4A2A863 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Itgb4A2A863 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Itgb4A2A863 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Itgb4A2A863 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Itgb4A2A863 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Itgb4A2A863 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Itgb4A2A863 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Itgb4A2A863 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Itgb4A2A863 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Itgb4A2A863 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Itgb4A2A863 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Itgb4A2A863 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Itgb4A2A863 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Itgb4A2A863 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Itgb4A2A863 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Itgb4A2A863 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Itgb4A2A863 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Itgb4A2A863 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Itgb4A2A863 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Itgb4A2A863 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Itgb4A2A863 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Itgb4A2A863 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Itgb4A2A863 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Itgb4A2A863 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Itgb4A2A863 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Itgb4A2A863 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Itgb4A2A863 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Itgb4A2A863 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Itgb4A2A863 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Itgb4A2A863 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Itgb4A2A863 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Itgb4A2A863 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Itgb4A2A863 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Itgb4A2A863 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Itgb4A2A863 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Itgb4A2A863 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms