Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SVP8

Gm5580, Predicted pseudogene 5580, mousemouse

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5580A0A0N4SVP8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm5580A0A0N4SVP8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm5580A0A0N4SVP8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm5580A0A0N4SVP8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm5580A0A0N4SVP8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm5580A0A0N4SVP8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm5580A0A0N4SVP8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm5580A0A0N4SVP8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm5580A0A0N4SVP8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm5580A0A0N4SVP8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm5580A0A0N4SVP8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm5580A0A0N4SVP8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm5580A0A0N4SVP8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm5580A0A0N4SVP8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm5580A0A0N4SVP8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm5580A0A0N4SVP8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm5580A0A0N4SVP8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm5580A0A0N4SVP8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm5580A0A0N4SVP8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm5580A0A0N4SVP8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm5580A0A0N4SVP8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm5580A0A0N4SVP8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm5580A0A0N4SVP8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm5580A0A0N4SVP8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm5580A0A0N4SVP8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm5580A0A0N4SVP8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm5580A0A0N4SVP8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm5580A0A0N4SVP8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm5580A0A0N4SVP8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm5580A0A0N4SVP8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm5580A0A0N4SVP8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm5580A0A0N4SVP8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm5580A0A0N4SVP8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm5580A0A0N4SVP8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm5580A0A0N4SVP8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm5580A0A0N4SVP8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm5580A0A0N4SVP8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm5580A0A0N4SVP8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm5580A0A0N4SVP8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm5580A0A0N4SVP8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm5580A0A0N4SVP8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm5580A0A0N4SVP8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm5580A0A0N4SVP8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm5580A0A0N4SVP8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm5580A0A0N4SVP8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm5580A0A0N4SVP8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm5580A0A0N4SVP8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm5580A0A0N4SVP8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm5580A0A0N4SVP8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm5580A0A0N4SVP8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm5580A0A0N4SVP8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm5580A0A0N4SVP8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm5580A0A0N4SVP8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm5580A0A0N4SVP8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm5580A0A0N4SVP8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm5580A0A0N4SVP8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm5580A0A0N4SVP8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm5580A0A0N4SVP8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm5580A0A0N4SVP8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm5580A0A0N4SVP8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm5580A0A0N4SVP8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm5580A0A0N4SVP8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm5580A0A0N4SVP8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm5580A0A0N4SVP8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm5580A0A0N4SVP8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm5580A0A0N4SVP8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm5580A0A0N4SVP8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm5580A0A0N4SVP8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm5580A0A0N4SVP8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm5580A0A0N4SVP8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm5580A0A0N4SVP8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm5580A0A0N4SVP8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm5580A0A0N4SVP8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm5580A0A0N4SVP8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm5580A0A0N4SVP8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm5580A0A0N4SVP8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm5580A0A0N4SVP8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm5580A0A0N4SVP8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm5580A0A0N4SVP8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm5580A0A0N4SVP8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm5580A0A0N4SVP8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm5580A0A0N4SVP8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm5580A0A0N4SVP8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm5580A0A0N4SVP8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm5580A0A0N4SVP8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm5580A0A0N4SVP8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm5580A0A0N4SVP8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm5580A0A0N4SVP8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm5580A0A0N4SVP8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm5580A0A0N4SVP8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm5580A0A0N4SVP8 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm5580A0A0N4SVP8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm5580A0A0N4SVP8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm5580A0A0N4SVP8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm5580A0A0N4SVP8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm5580A0A0N4SVP8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm5580A0A0N4SVP8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm5580A0A0N4SVP8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm5580A0A0N4SVP8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm5580A0A0N4SVP8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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