Protein–RNA interactions for Protein: A0A0M3U1B0

Sycp2l, Synaptonemal complex protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2lA0A0M3U1B0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sycp2lA0A0M3U1B0 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sycp2lA0A0M3U1B0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sycp2lA0A0M3U1B0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sycp2lA0A0M3U1B0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sycp2lA0A0M3U1B0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sycp2lA0A0M3U1B0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sycp2lA0A0M3U1B0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sycp2lA0A0M3U1B0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sycp2lA0A0M3U1B0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sycp2lA0A0M3U1B0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sycp2lA0A0M3U1B0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sycp2lA0A0M3U1B0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sycp2lA0A0M3U1B0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sycp2lA0A0M3U1B0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sycp2lA0A0M3U1B0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sycp2lA0A0M3U1B0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sycp2lA0A0M3U1B0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sycp2lA0A0M3U1B0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sycp2lA0A0M3U1B0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sycp2lA0A0M3U1B0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sycp2lA0A0M3U1B0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sycp2lA0A0M3U1B0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Sycp2lA0A0M3U1B0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sycp2lA0A0M3U1B0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sycp2lA0A0M3U1B0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sycp2lA0A0M3U1B0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sycp2lA0A0M3U1B0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sycp2lA0A0M3U1B0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sycp2lA0A0M3U1B0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sycp2lA0A0M3U1B0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sycp2lA0A0M3U1B0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sycp2lA0A0M3U1B0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sycp2lA0A0M3U1B0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sycp2lA0A0M3U1B0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sycp2lA0A0M3U1B0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sycp2lA0A0M3U1B0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sycp2lA0A0M3U1B0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sycp2lA0A0M3U1B0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sycp2lA0A0M3U1B0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sycp2lA0A0M3U1B0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sycp2lA0A0M3U1B0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sycp2lA0A0M3U1B0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sycp2lA0A0M3U1B0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sycp2lA0A0M3U1B0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sycp2lA0A0M3U1B0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sycp2lA0A0M3U1B0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sycp2lA0A0M3U1B0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sycp2lA0A0M3U1B0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sycp2lA0A0M3U1B0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sycp2lA0A0M3U1B0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sycp2lA0A0M3U1B0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sycp2lA0A0M3U1B0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sycp2lA0A0M3U1B0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sycp2lA0A0M3U1B0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sycp2lA0A0M3U1B0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sycp2lA0A0M3U1B0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sycp2lA0A0M3U1B0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sycp2lA0A0M3U1B0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sycp2lA0A0M3U1B0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sycp2lA0A0M3U1B0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sycp2lA0A0M3U1B0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sycp2lA0A0M3U1B0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sycp2lA0A0M3U1B0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sycp2lA0A0M3U1B0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Sycp2lA0A0M3U1B0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sycp2lA0A0M3U1B0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sycp2lA0A0M3U1B0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sycp2lA0A0M3U1B0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sycp2lA0A0M3U1B0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sycp2lA0A0M3U1B0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sycp2lA0A0M3U1B0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sycp2lA0A0M3U1B0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sycp2lA0A0M3U1B0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sycp2lA0A0M3U1B0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sycp2lA0A0M3U1B0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sycp2lA0A0M3U1B0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sycp2lA0A0M3U1B0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sycp2lA0A0M3U1B0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms