Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YWQ1

Trbv23, T cell receptor beta, variable V23 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trbv23A0A0A6YWQ1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Trbv23A0A0A6YWQ1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trbv23A0A0A6YWQ1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trbv23A0A0A6YWQ1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trbv23A0A0A6YWQ1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trbv23A0A0A6YWQ1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trbv23A0A0A6YWQ1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trbv23A0A0A6YWQ1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trbv23A0A0A6YWQ1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trbv23A0A0A6YWQ1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trbv23A0A0A6YWQ1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trbv23A0A0A6YWQ1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trbv23A0A0A6YWQ1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trbv23A0A0A6YWQ1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trbv23A0A0A6YWQ1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trbv23A0A0A6YWQ1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Trbv23A0A0A6YWQ1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Trbv23A0A0A6YWQ1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trbv23A0A0A6YWQ1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trbv23A0A0A6YWQ1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trbv23A0A0A6YWQ1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trbv23A0A0A6YWQ1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trbv23A0A0A6YWQ1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trbv23A0A0A6YWQ1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trbv23A0A0A6YWQ1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trbv23A0A0A6YWQ1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trbv23A0A0A6YWQ1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trbv23A0A0A6YWQ1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trbv23A0A0A6YWQ1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trbv23A0A0A6YWQ1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trbv23A0A0A6YWQ1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trbv23A0A0A6YWQ1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trbv23A0A0A6YWQ1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trbv23A0A0A6YWQ1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trbv23A0A0A6YWQ1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trbv23A0A0A6YWQ1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trbv23A0A0A6YWQ1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trbv23A0A0A6YWQ1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trbv23A0A0A6YWQ1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trbv23A0A0A6YWQ1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trbv23A0A0A6YWQ1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trbv23A0A0A6YWQ1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trbv23A0A0A6YWQ1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trbv23A0A0A6YWQ1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trbv23A0A0A6YWQ1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trbv23A0A0A6YWQ1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trbv23A0A0A6YWQ1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trbv23A0A0A6YWQ1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trbv23A0A0A6YWQ1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trbv23A0A0A6YWQ1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trbv23A0A0A6YWQ1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trbv23A0A0A6YWQ1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trbv23A0A0A6YWQ1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trbv23A0A0A6YWQ1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trbv23A0A0A6YWQ1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trbv23A0A0A6YWQ1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trbv23A0A0A6YWQ1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trbv23A0A0A6YWQ1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trbv23A0A0A6YWQ1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 298.8 ms