Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WPJ1

1700017N19Rik, RIKEN cDNA 1700017N19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700017N19RikA0A087WPJ1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
1700017N19RikA0A087WPJ1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
1700017N19RikA0A087WPJ1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
1700017N19RikA0A087WPJ1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
1700017N19RikA0A087WPJ1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
1700017N19RikA0A087WPJ1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
1700017N19RikA0A087WPJ1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
1700017N19RikA0A087WPJ1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
1700017N19RikA0A087WPJ1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
1700017N19RikA0A087WPJ1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
1700017N19RikA0A087WPJ1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
1700017N19RikA0A087WPJ1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
1700017N19RikA0A087WPJ1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
1700017N19RikA0A087WPJ1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
1700017N19RikA0A087WPJ1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
1700017N19RikA0A087WPJ1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
1700017N19RikA0A087WPJ1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
1700017N19RikA0A087WPJ1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
1700017N19RikA0A087WPJ1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
1700017N19RikA0A087WPJ1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
1700017N19RikA0A087WPJ1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
1700017N19RikA0A087WPJ1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
1700017N19RikA0A087WPJ1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
1700017N19RikA0A087WPJ1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
1700017N19RikA0A087WPJ1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
1700017N19RikA0A087WPJ1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
1700017N19RikA0A087WPJ1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
1700017N19RikA0A087WPJ1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
1700017N19RikA0A087WPJ1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
1700017N19RikA0A087WPJ1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
1700017N19RikA0A087WPJ1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
1700017N19RikA0A087WPJ1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
1700017N19RikA0A087WPJ1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
1700017N19RikA0A087WPJ1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
1700017N19RikA0A087WPJ1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
1700017N19RikA0A087WPJ1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
1700017N19RikA0A087WPJ1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
1700017N19RikA0A087WPJ1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
1700017N19RikA0A087WPJ1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
1700017N19RikA0A087WPJ1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
1700017N19RikA0A087WPJ1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700017N19RikA0A087WPJ1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700017N19RikA0A087WPJ1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700017N19RikA0A087WPJ1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700017N19RikA0A087WPJ1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700017N19RikA0A087WPJ1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700017N19RikA0A087WPJ1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700017N19RikA0A087WPJ1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700017N19RikA0A087WPJ1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700017N19RikA0A087WPJ1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700017N19RikA0A087WPJ1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700017N19RikA0A087WPJ1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
1700017N19RikA0A087WPJ1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
1700017N19RikA0A087WPJ1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
1700017N19RikA0A087WPJ1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
1700017N19RikA0A087WPJ1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
1700017N19RikA0A087WPJ1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
1700017N19RikA0A087WPJ1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
1700017N19RikA0A087WPJ1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
1700017N19RikA0A087WPJ1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
1700017N19RikA0A087WPJ1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
1700017N19RikA0A087WPJ1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
1700017N19RikA0A087WPJ1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
1700017N19RikA0A087WPJ1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
1700017N19RikA0A087WPJ1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
1700017N19RikA0A087WPJ1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
1700017N19RikA0A087WPJ1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
1700017N19RikA0A087WPJ1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
1700017N19RikA0A087WPJ1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
1700017N19RikA0A087WPJ1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
1700017N19RikA0A087WPJ1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
1700017N19RikA0A087WPJ1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
1700017N19RikA0A087WPJ1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
1700017N19RikA0A087WPJ1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
1700017N19RikA0A087WPJ1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
1700017N19RikA0A087WPJ1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
1700017N19RikA0A087WPJ1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
1700017N19RikA0A087WPJ1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
1700017N19RikA0A087WPJ1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
1700017N19RikA0A087WPJ1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
1700017N19RikA0A087WPJ1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
1700017N19RikA0A087WPJ1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
1700017N19RikA0A087WPJ1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
1700017N19RikA0A087WPJ1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms