Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Gm12912-201ENSMUST00000121596 1381 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 E330011O21Rik-204ENSMUST00000210839 1361 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Gm15519-201ENSMUST00000120088 1566 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Gm23769-201ENSMUST00000104441 121 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Gm3409-202ENSMUST00000110599 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Gm12418-201ENSMUST00000118116 942 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Ccl19-ps1-201ENSMUST00000119621 327 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Platr3-201ENSMUST00000146980 412 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Gm17134-201ENSMUST00000166593 437 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Gm3415-202ENSMUST00000179214 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Plac9a-203ENSMUST00000183725 439 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Plac9b-202ENSMUST00000183811 396 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Gm37197-201ENSMUST00000195607 401 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Gm7880-201ENSMUST00000203748 871 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Gm31520-203ENSMUST00000204874 647 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Gm44559-201ENSMUST00000207177 1012 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 AC122305.3-201ENSMUST00000214762 361 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Gm30709-202ENSMUST00000222476 956 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 AC164099.1-201ENSMUST00000227780 333 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 3830403N18Rik-201ENSMUST00000033458 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Olfr1161-201ENSMUST00000054845 1012 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Desi2-202ENSMUST00000069568 1193 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Gm12159-201ENSMUST00000143869 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Gm44090-201ENSMUST00000204669 1834 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Trav10d-201ENSMUST00000103646 406 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Gm24279-201ENSMUST00000104236 131 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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