Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Dhdds-209ENSMUST00000144668 3219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Gm5910-201ENSMUST00000211819 1746 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Gm3372-201ENSMUST00000198806 1792 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Med24-202ENSMUST00000100500 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 AC130671.3-201ENSMUST00000227393 1897 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Ighv14-3-201ENSMUST00000103469 399 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Gm25723-201ENSMUST00000104530 126 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Mrps33-202ENSMUST00000114797 500 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Gm15661-201ENSMUST00000117390 556 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Gm15264-201ENSMUST00000118050 502 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 0610037L13Rik-206ENSMUST00000120473 835 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 4933424L21Rik-201ENSMUST00000142486 1186 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Gm27241-201ENSMUST00000183517 622 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Gm7924-201ENSMUST00000203975 785 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Rab38-202ENSMUST00000208478 579 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Gm3889-201ENSMUST00000212467 612 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Gm32743-201ENSMUST00000214196 594 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Gm28653-202ENSMUST00000227082 521 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Tas2r135-201ENSMUST00000070178 1093 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Gm45871-204ENSMUST00000211710 2003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Fcrla-203ENSMUST00000159171 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Gm11497-201ENSMUST00000138295 2154 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Gm44907-201ENSMUST00000207423 1633 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Ighv8-6-201ENSMUST00000103524 301 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Gm13303-201ENSMUST00000117125 1284 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Gm12047-201ENSMUST00000117561 944 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 4930589P08Rik-201ENSMUST00000129097 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Gm12668-201ENSMUST00000134966 575 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Pttg1ip-208ENSMUST00000162943 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Sfta2-201ENSMUST00000171166 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Mir6981-201ENSMUST00000184293 115 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Gm37016-201ENSMUST00000195507 660 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Btg4-202ENSMUST00000213117 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Gm46210-201ENSMUST00000218800 577 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 AC132881.1-201ENSMUST00000223780 1062 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Gal-201ENSMUST00000025842 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Scgb3a1-201ENSMUST00000043873 493 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Gm10053-201ENSMUST00000073080 949 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Scgb3a1-202ENSMUST00000076006 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Gm7061-201ENSMUST00000118127 1416 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Gm45110-201ENSMUST00000205704 1402 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Gm45847-201ENSMUST00000209402 1880 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Gm10842-201ENSMUST00000100338 369 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Eddm3b-201ENSMUST00000100645 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Gm16439-201ENSMUST00000100687 564 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Micalcl-203ENSMUST00000106645 2309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Gm12737-201ENSMUST00000142835 725 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Gm12927-201ENSMUST00000150252 373 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Plrg1-204ENSMUST00000150268 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Gm28809-201ENSMUST00000187542 782 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Gm42764-201ENSMUST00000197835 741 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Gm8083-201ENSMUST00000203976 475 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 AC157650.1-201ENSMUST00000224582 610 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 3110083C13Rik-202ENSMUST00000224786 907 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 AC123698.1-201ENSMUST00000227090 402 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Gm8256-202ENSMUST00000227964 828 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Gba-201ENSMUST00000077367 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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