Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tlr5Q9JLF7 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tlr5Q9JLF7 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tlr5Q9JLF7 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Tlr5Q9JLF7 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tlr5Q9JLF7 Mir8091-201ENSMUST00000183602 139 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Tlr5Q9JLF7 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Tlr5Q9JLF7 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tlr5Q9JLF7 Gm5865-201ENSMUST00000198713 637 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Tlr5Q9JLF7 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tlr5Q9JLF7 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Tlr5Q9JLF7 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tlr5Q9JLF7 AC165249.1-202ENSMUST00000217990 734 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tlr5Q9JLF7 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Tlr5Q9JLF7 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Tlr5Q9JLF7 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Tlr5Q9JLF7 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tlr5Q9JLF7 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tlr5Q9JLF7 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tlr5Q9JLF7 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tlr5Q9JLF7 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tlr5Q9JLF7 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tlr5Q9JLF7 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tlr5Q9JLF7 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tlr5Q9JLF7 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tlr5Q9JLF7 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tlr5Q9JLF7 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tlr5Q9JLF7 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Tlr5Q9JLF7 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tlr5Q9JLF7 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tlr5Q9JLF7 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tlr5Q9JLF7 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tlr5Q9JLF7 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tlr5Q9JLF7 Wdr46-ps-201ENSMUST00000200591 1712 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Tlr5Q9JLF7 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tlr5Q9JLF7 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tlr5Q9JLF7 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tlr5Q9JLF7 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tlr5Q9JLF7 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tlr5Q9JLF7 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tlr5Q9JLF7 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tlr5Q9JLF7 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tlr5Q9JLF7 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tlr5Q9JLF7 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Tlr5Q9JLF7 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tlr5Q9JLF7 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tlr5Q9JLF7 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tlr5Q9JLF7 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tlr5Q9JLF7 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tlr5Q9JLF7 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tlr5Q9JLF7 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tlr5Q9JLF7 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Tlr5Q9JLF7 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tlr5Q9JLF7 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Tlr5Q9JLF7 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tlr5Q9JLF7 Gm5244-201ENSMUST00000164001 339 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Tlr5Q9JLF7 Park2-203ENSMUST00000168593 735 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tlr5Q9JLF7 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tlr5Q9JLF7 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Tlr5Q9JLF7 Gm28624-201ENSMUST00000186430 2131 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Tlr5Q9JLF7 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Tlr5Q9JLF7 Gm7047-201ENSMUST00000196224 1063 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Tlr5Q9JLF7 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tlr5Q9JLF7 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tlr5Q9JLF7 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tlr5Q9JLF7 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tlr5Q9JLF7 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tlr5Q9JLF7 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tlr5Q9JLF7 AC116680.1-201ENSMUST00000222804 613 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tlr5Q9JLF7 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tlr5Q9JLF7 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tlr5Q9JLF7 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tlr5Q9JLF7 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Tlr5Q9JLF7 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tlr5Q9JLF7 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tlr5Q9JLF7 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tlr5Q9JLF7 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tlr5Q9JLF7 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tlr5Q9JLF7 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tlr5Q9JLF7 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tlr5Q9JLF7 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tlr5Q9JLF7 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tlr5Q9JLF7 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tlr5Q9JLF7 Eif2s3y-201ENSMUST00000091197 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tlr5Q9JLF7 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tlr5Q9JLF7 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tlr5Q9JLF7 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tlr5Q9JLF7 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tlr5Q9JLF7 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tlr5Q9JLF7 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tlr5Q9JLF7 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tlr5Q9JLF7 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tlr5Q9JLF7 Slc6a12-209ENSMUST00000171008 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tlr5Q9JLF7 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tlr5Q9JLF7 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tlr5Q9JLF7 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tlr5Q9JLF7 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tlr5Q9JLF7 Stau2-202ENSMUST00000054668 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tlr5Q9JLF7 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tlr5Q9JLF7 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms