Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Gm1661-201ENSMUST00000077500 1422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Pole-202ENSMUST00000112481 1523 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Gm42521-201ENSMUST00000199190 2040 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Stau2-202ENSMUST00000054668 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Myadm-202ENSMUST00000164553 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Zbed3Q9D0L1 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
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Zbed3Q9D0L1 Slc10a1-201ENSMUST00000095572 1674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Gm26912-201ENSMUST00000180988 1483 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Zbed3Q9D0L1 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Zbed3Q9D0L1 Gm42423-201ENSMUST00000196396 670 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Zbed3Q9D0L1 Ghrl-203ENSMUST00000203588 237 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Gm6518-201ENSMUST00000208450 342 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Gm32786-201ENSMUST00000211351 628 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 BC049987-201ENSMUST00000213859 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Zbed3Q9D0L1 Mptx1-201ENSMUST00000027816 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Stpg4-201ENSMUST00000040609 847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Ggta1-201ENSMUST00000044255 1221 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Zbed3Q9D0L1 Gemin8-203ENSMUST00000096252 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Defa3-201ENSMUST00000098893 410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Dedd-202ENSMUST00000097467 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Zbed3Q9D0L1 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Gm8122-201ENSMUST00000165988 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Zbed3Q9D0L1 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Ms4a7-203ENSMUST00000067532 1334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Olfr463-203ENSMUST00000217095 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
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Zbed3Q9D0L1 AC160060.1-201ENSMUST00000217840 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Cryzl1-202ENSMUST00000114023 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Gm16209-201ENSMUST00000118457 627 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
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Zbed3Q9D0L1 3010001F23Rik-201ENSMUST00000130625 876 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 2210408F21Rik-209ENSMUST00000146778 579 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Gm18123-201ENSMUST00000210874 822 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Gm18122-201ENSMUST00000211390 904 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 4930546C10Rik-201ENSMUST00000025428 363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Rps9-201ENSMUST00000006496 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Gm10233-201ENSMUST00000089275 628 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Gm10238-201ENSMUST00000089689 408 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Lrrc4-201ENSMUST00000062304 3615 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 3000002C10Rik-201ENSMUST00000125451 1614 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Scnn1g-201ENSMUST00000000221 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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