Protein–RNA interactions for Protein: Q8K099

Lrit1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit1Q8K099 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 5930420M18Rik-201ENSMUST00000202893 2281 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Krt34-201ENSMUST00000056362 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Mak16-201ENSMUST00000033983 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Gm24470-201ENSMUST00000104486 132 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Rgs8-205ENSMUST00000111815 765 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Fhl1-206ENSMUST00000116596 1203 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Gm6881-201ENSMUST00000121811 833 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Gm12362-201ENSMUST00000121986 342 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Optc-204ENSMUST00000149380 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Gm16552-201ENSMUST00000162348 685 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Gm20467-201ENSMUST00000172872 994 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 1110025M09Rik-201ENSMUST00000192082 855 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Gm37819-201ENSMUST00000194626 1065 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Gm45225-201ENSMUST00000206852 1139 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Acsm5-204ENSMUST00000207387 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Cacna2d3-208ENSMUST00000225985 918 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Bpifa5-201ENSMUST00000028986 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Tmigd1-202ENSMUST00000102495 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Rab38-201ENSMUST00000107256 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Gm45871-204ENSMUST00000211710 2003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Scnn1g-201ENSMUST00000000221 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Gm26637-201ENSMUST00000180880 2289 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 S100a16-205ENSMUST00000107334 879 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Oosp2-201ENSMUST00000121793 677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Cyp2j15-ps-201ENSMUST00000122267 686 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Gm11629-201ENSMUST00000123784 384 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Apela-201ENSMUST00000124790 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Gm28845-201ENSMUST00000144760 733 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Scgb1b21-201ENSMUST00000170232 268 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Rian-210ENSMUST00000182689 295 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Rwdd2a-203ENSMUST00000185566 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Gm28916-201ENSMUST00000186988 699 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Gm28806-201ENSMUST00000191134 528 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Ighv1-8-201ENSMUST00000192236 293 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Wdr46-ps-201ENSMUST00000200591 1712 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Gm6426-201ENSMUST00000209048 854 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Btg4-202ENSMUST00000213117 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 CR974487.1-201ENSMUST00000220984 413 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 AC123698.1-201ENSMUST00000227090 402 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Elobl-202ENSMUST00000082339 300 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Sun1-205ENSMUST00000110883 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Gm7001-201ENSMUST00000219384 1465 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Tex9-214ENSMUST00000184831 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms