Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWR4

Usp40, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp40Q8BWR4 Gm14320-201ENSMUST00000137275 1023 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp40Q8BWR4 Gm24346-201ENSMUST00000158712 194 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp40Q8BWR4 Gm16587-201ENSMUST00000161943 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp40Q8BWR4 Mir8111-201ENSMUST00000184463 137 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp40Q8BWR4 Gm27316-201ENSMUST00000184884 277 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp40Q8BWR4 Gm42732-201ENSMUST00000202887 1197 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp40Q8BWR4 Gpx4-ps2-201ENSMUST00000214811 555 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp40Q8BWR4 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp40Q8BWR4 Ccl27a-201ENSMUST00000074387 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp40Q8BWR4 Mir326-201ENSMUST00000083637 95 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp40Q8BWR4 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp40Q8BWR4 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp40Q8BWR4 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp40Q8BWR4 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp40Q8BWR4 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp40Q8BWR4 Acnat1-201ENSMUST00000095086 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp40Q8BWR4 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp40Q8BWR4 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp40Q8BWR4 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp40Q8BWR4 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp40Q8BWR4 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp40Q8BWR4 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp40Q8BWR4 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp40Q8BWR4 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp40Q8BWR4 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp40Q8BWR4 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp40Q8BWR4 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp40Q8BWR4 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp40Q8BWR4 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp40Q8BWR4 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp40Q8BWR4 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp40Q8BWR4 Krt40-202ENSMUST00000107443 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp40Q8BWR4 Lime1-202ENSMUST00000108804 960 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp40Q8BWR4 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp40Q8BWR4 Gm5395-201ENSMUST00000121650 915 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Usp40Q8BWR4 Eef1d-217ENSMUST00000151066 704 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp40Q8BWR4 1700057H21Rik-202ENSMUST00000154530 506 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp40Q8BWR4 Gm4778-202ENSMUST00000159517 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp40Q8BWR4 Cd9-ps-201ENSMUST00000174687 650 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Usp40Q8BWR4 Gm7445-201ENSMUST00000192115 340 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Usp40Q8BWR4 Gm37207-201ENSMUST00000194284 296 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Usp40Q8BWR4 Gm8234-201ENSMUST00000198523 1107 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Usp40Q8BWR4 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Usp40Q8BWR4 AC154806.7-201ENSMUST00000227998 202 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Usp40Q8BWR4 Rps3a2-201ENSMUST00000074245 792 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Usp40Q8BWR4 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp40Q8BWR4 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp40Q8BWR4 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp40Q8BWR4 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp40Q8BWR4 Rbm8a-201ENSMUST00000048915 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp40Q8BWR4 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp40Q8BWR4 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp40Q8BWR4 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp40Q8BWR4 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp40Q8BWR4 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp40Q8BWR4 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp40Q8BWR4 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp40Q8BWR4 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp40Q8BWR4 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp40Q8BWR4 Rep15-201ENSMUST00000036194 1662 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp40Q8BWR4 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp40Q8BWR4 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp40Q8BWR4 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp40Q8BWR4 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp40Q8BWR4 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp40Q8BWR4 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp40Q8BWR4 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp40Q8BWR4 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp40Q8BWR4 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp40Q8BWR4 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp40Q8BWR4 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp40Q8BWR4 Psmc1-201ENSMUST00000021595 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp40Q8BWR4 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp40Q8BWR4 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp40Q8BWR4 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp40Q8BWR4 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp40Q8BWR4 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp40Q8BWR4 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp40Q8BWR4 Gm8019-201ENSMUST00000119317 587 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp40Q8BWR4 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp40Q8BWR4 Gm11205-201ENSMUST00000137738 431 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp40Q8BWR4 Gm5808-201ENSMUST00000178090 357 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp40Q8BWR4 Tcstv1-201ENSMUST00000178510 1280 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp40Q8BWR4 Nkain2-205ENSMUST00000219125 1166 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp40Q8BWR4 Vps25-201ENSMUST00000007533 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp40Q8BWR4 2310016G11Rik-201ENSMUST00000094460 992 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp40Q8BWR4 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp40Q8BWR4 5031425E22Rik-202ENSMUST00000185943 1477 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp40Q8BWR4 Cpvl-202ENSMUST00000203101 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp40Q8BWR4 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp40Q8BWR4 Edn1-201ENSMUST00000021796 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp40Q8BWR4 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp40Q8BWR4 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp40Q8BWR4 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp40Q8BWR4 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp40Q8BWR4 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp40Q8BWR4 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp40Q8BWR4 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp40Q8BWR4 Gad1-ps-201ENSMUST00000167243 1776 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp40Q8BWR4 Npy1r-201ENSMUST00000039303 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.3 ms