Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Gsdma3-202ENSMUST00000107508 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Dhdds-209ENSMUST00000144668 3219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Gm8216-201ENSMUST00000117232 601 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Zfp738-202ENSMUST00000125495 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Maats1os-201ENSMUST00000133496 326 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Gm13898-201ENSMUST00000141865 610 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Gm12972-201ENSMUST00000152986 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Gm14341-201ENSMUST00000154616 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 2700099C18Rik-203ENSMUST00000182475 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Gm29487-201ENSMUST00000190146 256 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Gm3945-201ENSMUST00000196637 683 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 4930573C15Rik-201ENSMUST00000197707 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Gm21149-201ENSMUST00000197995 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 AC161877.1-201ENSMUST00000227736 699 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Gm23458-201ENSMUST00000083257 169 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 CN725425-201ENSMUST00000109284 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 A1bg-201ENSMUST00000096418 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 Ucp1-201ENSMUST00000034146 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 Gm12498-201ENSMUST00000138374 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 Tnnt3-203ENSMUST00000105941 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 Tnnt3-204ENSMUST00000105942 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 Tnnt3-205ENSMUST00000105943 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 Tnnt3-207ENSMUST00000105945 747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 Tnnt3-208ENSMUST00000105946 765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 Gm11771-201ENSMUST00000118124 732 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 Gm26356-201ENSMUST00000158217 283 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 Mir6396-201ENSMUST00000183603 111 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 1700052H01Rik-201ENSMUST00000196142 717 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 Gm42375-201ENSMUST00000206226 745 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 Tnfrsf14-205ENSMUST00000219534 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 AC154347.2-201ENSMUST00000221223 715 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 Olfr1384-201ENSMUST00000060434 1034 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 Tas2r135-201ENSMUST00000070178 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 Gm3372-201ENSMUST00000198806 1792 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 Vwa3b-205ENSMUST00000162449 1360 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 Igsf5-201ENSMUST00000000163 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 Ppp6c-205ENSMUST00000204701 1495 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 Timm10b-203ENSMUST00000106783 3273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 Gm42449-201ENSMUST00000200349 2258 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 Snrnp27-201ENSMUST00000001186 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 Gm11701-201ENSMUST00000121277 1142 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 Ubl5-203ENSMUST00000160124 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 Gm18124-201ENSMUST00000210695 706 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 Nqo2-203ENSMUST00000220844 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 Gm9869-201ENSMUST00000063858 375 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 Hcst-201ENSMUST00000075062 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 Olfr272-202ENSMUST00000107667 1936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 Ankrd36-201ENSMUST00000109855 1363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 Kyat1-203ENSMUST00000113660 1388 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms