Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Gpr19-201ENSMUST00000046255 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Ppp6r2-201ENSMUST00000088788 2887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Skp2-201ENSMUST00000096482 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Olfr272-202ENSMUST00000107667 1936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Fam161a-201ENSMUST00000058269 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Atl2-201ENSMUST00000068282 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Gm15832-201ENSMUST00000146314 1832 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Mdm1-203ENSMUST00000164077 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Tmem67-202ENSMUST00000108293 3945 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Tmem154-201ENSMUST00000107682 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Pigo-202ENSMUST00000098109 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Il10ra-202ENSMUST00000176222 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Ing3-202ENSMUST00000115389 2546 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Gckr-202ENSMUST00000201166 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q8BGC1 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Gm4812-201ENSMUST00000182847 993 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Gm19412-201ENSMUST00000185388 436 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q8BGC1 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q8BGC1 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Q8BGC1 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Acadsb-202ENSMUST00000117518 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Mrps23-201ENSMUST00000024486 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q8BGC1 St6galnac4-201ENSMUST00000102818 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Gm43052-201ENSMUST00000201451 1628 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Gm364-201ENSMUST00000114725 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Gpi1-201ENSMUST00000038027 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Actn2-201ENSMUST00000064204 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Uaca-201ENSMUST00000050183 4428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Lpxn-201ENSMUST00000025601 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Gm32200-201ENSMUST00000192778 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q8BGC1 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Nemp2-201ENSMUST00000165859 3396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q8BGC1 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q8BGC1 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Q8BGC1 6820431F20Rik-201ENSMUST00000150051 936 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Gm11915-201ENSMUST00000153669 358 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Q8BGC1 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms