Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Gm37207-201ENSMUST00000194284 296 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Gm43610-201ENSMUST00000199117 365 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 E230034D01Rik-203ENSMUST00000217357 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Ccl27a-201ENSMUST00000074387 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Edn1-201ENSMUST00000021796 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 C920021L13Rik-201ENSMUST00000120398 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Stau2-202ENSMUST00000054668 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Gm12530-201ENSMUST00000152074 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Krt40-202ENSMUST00000107443 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Gm8019-201ENSMUST00000119317 587 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Gm5395-201ENSMUST00000121650 915 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Gm14320-201ENSMUST00000137275 1023 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Gm4778-202ENSMUST00000159517 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Gm20493-201ENSMUST00000173706 213 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Mir8111-201ENSMUST00000184463 137 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Gm7445-201ENSMUST00000192115 340 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Gm7238-201ENSMUST00000206467 973 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 AC155300.1-201ENSMUST00000219134 480 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 AC154806.7-201ENSMUST00000227998 202 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Npy1r-201ENSMUST00000039303 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Rep15-201ENSMUST00000036194 1662 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Msl1-202ENSMUST00000037930 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Rbm8a-201ENSMUST00000048915 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Lime1-202ENSMUST00000108804 960 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Gm12418-201ENSMUST00000118116 942 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 AC034099.1-202ENSMUST00000133843 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Gm5808-201ENSMUST00000178090 357 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Tcstv1-201ENSMUST00000178510 1280 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 AC152169.1-201ENSMUST00000223901 701 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Olfr63-201ENSMUST00000067840 955 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Vps25-201ENSMUST00000007533 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Psmd12-202ENSMUST00000106750 1311 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Teddm3-201ENSMUST00000170665 1346 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 B430203G13Rik-201ENSMUST00000169657 1375 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Gm5697-201ENSMUST00000122295 2482 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Gab3-202ENSMUST00000114104 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Psmb3-201ENSMUST00000103147 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Pex5l-203ENSMUST00000108221 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Mapk8-202ENSMUST00000111942 927 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Ptgds-203ENSMUST00000114259 775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trak1Q6PD31 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms