Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp49Q6P9L4 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp49Q6P9L4 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp49Q6P9L4 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp49Q6P9L4 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp49Q6P9L4 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp49Q6P9L4 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp49Q6P9L4 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp49Q6P9L4 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Usp49Q6P9L4 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp49Q6P9L4 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
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Usp49Q6P9L4 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp49Q6P9L4 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp49Q6P9L4 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
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Usp49Q6P9L4 Gm29283-201ENSMUST00000187394 288 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Usp49Q6P9L4 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Usp49Q6P9L4 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Usp49Q6P9L4 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp49Q6P9L4 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Usp49Q6P9L4 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp49Q6P9L4 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp49Q6P9L4 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp49Q6P9L4 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp49Q6P9L4 E330021D16Rik-201ENSMUST00000058713 1116 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp49Q6P9L4 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp49Q6P9L4 Sh3gl2-204ENSMUST00000107189 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp49Q6P9L4 Dgkh-201ENSMUST00000074729 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Usp49Q6P9L4 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Usp49Q6P9L4 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp49Q6P9L4 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Usp49Q6P9L4 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp49Q6P9L4 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp49Q6P9L4 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp49Q6P9L4 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp49Q6P9L4 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp49Q6P9L4 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp49Q6P9L4 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp49Q6P9L4 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Usp49Q6P9L4 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp49Q6P9L4 Eif2s3y-201ENSMUST00000091197 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp49Q6P9L4 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp49Q6P9L4 Anxa7-201ENSMUST00000065504 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp49Q6P9L4 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp49Q6P9L4 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp49Q6P9L4 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp49Q6P9L4 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp49Q6P9L4 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp49Q6P9L4 Pde4c-202ENSMUST00000110095 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Usp49Q6P9L4 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Usp49Q6P9L4 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp49Q6P9L4 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Usp49Q6P9L4 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp49Q6P9L4 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp49Q6P9L4 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp49Q6P9L4 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp49Q6P9L4 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp49Q6P9L4 Uimc1-204ENSMUST00000127195 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp49Q6P9L4 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp49Q6P9L4 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp49Q6P9L4 Gab3-202ENSMUST00000114104 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp49Q6P9L4 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp49Q6P9L4 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp49Q6P9L4 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp49Q6P9L4 Dnajc14-202ENSMUST00000217745 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp49Q6P9L4 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp49Q6P9L4 Tank-204ENSMUST00000112501 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp49Q6P9L4 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp49Q6P9L4 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp49Q6P9L4 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp49Q6P9L4 Pax6-206ENSMUST00000111086 2601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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