Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Morf4l2-213ENSMUST00000166478 1720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Bcl2l11-204ENSMUST00000103211 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 1700025C18Rik-201ENSMUST00000109304 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Gm15554-201ENSMUST00000120406 913 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Gm15287-201ENSMUST00000132564 751 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Psmb6-ps2-201ENSMUST00000187074 705 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Gm42493-201ENSMUST00000197559 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Gm18466-201ENSMUST00000209147 499 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 AC101205.2-201ENSMUST00000226206 715 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Ttc24-202ENSMUST00000064550 671 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Prok2-201ENSMUST00000008273 594 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Gm12097-201ENSMUST00000121523 1414 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Acnat1-201ENSMUST00000095086 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Hyal2-206ENSMUST00000195681 2968 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 AC154354.1-203ENSMUST00000225565 1364 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Gm22582-201ENSMUST00000102283 94 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Ighv1-74-201ENSMUST00000103543 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Cidec-203ENSMUST00000113091 785 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Gm16209-201ENSMUST00000118457 627 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Gm10171-201ENSMUST00000126220 628 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Gm12606-202ENSMUST00000129527 1184 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Gm12688-201ENSMUST00000136525 701 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Gm7572-201ENSMUST00000182616 766 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Rian-210ENSMUST00000182689 295 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Gm37885-202ENSMUST00000195868 685 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Gm45812-201ENSMUST00000212199 192 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 AC105408.1-201ENSMUST00000227771 802 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Tsga8-201ENSMUST00000049420 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Ifnl3-201ENSMUST00000078364 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Gm10233-201ENSMUST00000089275 628 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Mak16-201ENSMUST00000033983 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Mettl8-201ENSMUST00000090849 1842 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 5730422E09Rik-201ENSMUST00000180733 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Plrg1-204ENSMUST00000150268 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Gm12498-201ENSMUST00000138374 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Trav10d-201ENSMUST00000103646 406 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Gm15886-201ENSMUST00000123155 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Gm29200-201ENSMUST00000188118 1085 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Gm18555-201ENSMUST00000197935 584 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Gm9619-201ENSMUST00000211587 762 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 AC152169.1-201ENSMUST00000223901 701 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Gm10238-201ENSMUST00000089689 408 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Ptges3l-201ENSMUST00000093933 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Gm6478-201ENSMUST00000099450 742 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Lrrc4-201ENSMUST00000062304 3615 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Asgr1-202ENSMUST00000092959 1308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Micu1-212ENSMUST00000179709 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Trbv31-201ENSMUST00000103300 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Polr2j-203ENSMUST00000111129 474 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Gm8659-201ENSMUST00000120024 1084 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 4930589P08Rik-201ENSMUST00000129097 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Gm14232-201ENSMUST00000137176 446 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms