Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Zwilch-209ENSMUST00000176299 1831 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Nr4a2-201ENSMUST00000028166 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Babam2-202ENSMUST00000071531 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Gm38227-201ENSMUST00000193036 1602 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Gm5046-201ENSMUST00000100608 611 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Gm12047-201ENSMUST00000117561 944 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Gm13898-201ENSMUST00000141865 610 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Gm9513-201ENSMUST00000165591 306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Gm3052-201ENSMUST00000186409 829 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Gm4430-202ENSMUST00000193902 1041 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 4930478P22Rik-202ENSMUST00000201921 723 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Gm24981-201ENSMUST00000104459 132 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Gstm6-204ENSMUST00000106684 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Gm13215-201ENSMUST00000117559 472 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Gm13778-202ENSMUST00000146633 537 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Optc-204ENSMUST00000149380 1180 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 4930458K08Rik-201ENSMUST00000219952 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Olfr1384-201ENSMUST00000060434 1034 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Vangl1-208ENSMUST00000168312 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Gm7790-201ENSMUST00000118716 1310 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 F730016J06Rik-201ENSMUST00000126140 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Gm2044-201ENSMUST00000130771 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
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Ccdc18Q640L5 Nudc-ps1-201ENSMUST00000209275 551 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Ift43-201ENSMUST00000054565 773 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Olfr464-205ENSMUST00000217112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Gm45076-201ENSMUST00000207517 1517 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Gm12420-201ENSMUST00000119869 1048 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Gm14152-201ENSMUST00000127020 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Aif1l-207ENSMUST00000148056 670 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Gm15587-202ENSMUST00000156403 709 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Mir3100-201ENSMUST00000174918 65 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Gm5627-201ENSMUST00000178539 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 D130017N08Rik-201ENSMUST00000180460 510 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Gm9273-201ENSMUST00000200606 715 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Gm45363-201ENSMUST00000210196 1294 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 AC124772.3-201ENSMUST00000222535 575 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 AC161877.1-201ENSMUST00000227736 699 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 AC123533.3-201ENSMUST00000228056 454 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Clec1b-201ENSMUST00000032262 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Olfr225-201ENSMUST00000055276 1260 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Rps18-201ENSMUST00000008812 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc18Q640L5 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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