Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

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Length 883 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BcanQ61361 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Triml2-201ENSMUST00000163869 1467 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Gm11475-201ENSMUST00000118482 476 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Gm11634-201ENSMUST00000154147 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Gm26647-201ENSMUST00000180816 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BcanQ61361 1810013D15Rik-201ENSMUST00000029827 300 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Ptges3l-201ENSMUST00000093933 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Prr16-201ENSMUST00000116639 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Magea2-202ENSMUST00000112559 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BcanQ61361 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BcanQ61361 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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BcanQ61361 Gm13707-201ENSMUST00000123663 600 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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BcanQ61361 Gm37452-201ENSMUST00000194416 1160 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Gm45085-201ENSMUST00000209100 441 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Gm45388-201ENSMUST00000209922 1132 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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BcanQ61361 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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BcanQ61361 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Prr19-201ENSMUST00000080288 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BcanQ61361 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BcanQ61361 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Pax5-212ENSMUST00000173733 885 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BcanQ61361 n-R5s130-201ENSMUST00000178128 119 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Gm24312-201ENSMUST00000178677 119 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
BcanQ61361 n-R5s106-201ENSMUST00000179060 119 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
BcanQ61361 n-R5s118-201ENSMUST00000179887 119 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Gm6855-201ENSMUST00000206307 790 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Gm2448-201ENSMUST00000207080 559 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
BcanQ61361 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Apoa5-205ENSMUST00000215187 495 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Gm40879-201ENSMUST00000220759 612 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms