Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQ97

Gm5460, Predicted gene 5460, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5460Q3UQ97 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Gm5460Q3UQ97 AC134793.1-202ENSMUST00000227444 803 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Gm5460Q3UQ97 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Gm5460Q3UQ97 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Gm5460Q3UQ97 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Gm5460Q3UQ97 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Gm5460Q3UQ97 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
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Gm5460Q3UQ97 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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