Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6092-201ENSMUST00000121659 2029 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms