Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Gm43084-201ENSMUST00000200696 947 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Srpx2-201ENSMUST00000033606 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Aplp2-201ENSMUST00000072634 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Nod1-202ENSMUST00000168172 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Nudcd3-201ENSMUST00000066496 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Slc28a1-202ENSMUST00000119083 2899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Ppp6r2-201ENSMUST00000088788 2887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Ctc1-202ENSMUST00000116359 3978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Palm2-201ENSMUST00000102904 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Rab36-207ENSMUST00000147802 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Slc6a12-201ENSMUST00000032200 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Hrh1-201ENSMUST00000088987 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Gm28722-201ENSMUST00000187630 1036 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Tsga8-201ENSMUST00000049420 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 AC158779.1-201ENSMUST00000228912 3861 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Pdgfra-202ENSMUST00000168162 6834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Tmem67-202ENSMUST00000108293 3945 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Gm44445-201ENSMUST00000204075 2683 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Lrtm2-201ENSMUST00000068351 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Rasal1-205ENSMUST00000156722 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Gm7598-201ENSMUST00000130251 3123 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Nlrx1-201ENSMUST00000034621 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Itgax-201ENSMUST00000033053 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Ampd3-206ENSMUST00000170374 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Ccdc148-204ENSMUST00000226455 4612 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 9430064I24Rik-201ENSMUST00000206516 2669 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms