Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Rpusd2Q149F1 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Gm7489-201ENSMUST00000100666 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Rpusd2Q149F1 Scgb2b7-201ENSMUST00000178258 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Rpusd2Q149F1 Chordc1-202ENSMUST00000213605 519 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Rpusd2Q149F1 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Rpusd2Q149F1 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Rpusd2Q149F1 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Rpusd2Q149F1 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Rpusd2Q149F1 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Tspan8-203ENSMUST00000179196 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Rpusd2Q149F1 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Gm13792-201ENSMUST00000121350 423 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
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Rpusd2Q149F1 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Gm13783-201ENSMUST00000131634 732 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Aknaos-201ENSMUST00000144095 1104 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Olfr772-201ENSMUST00000169800 1004 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Rpusd2Q149F1 Gm27209-201ENSMUST00000183834 898 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
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