Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Gm19927-201ENSMUST00000185792 781 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Gm8162-201ENSMUST00000213951 665 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Rtn4ip1-202ENSMUST00000105492 2059 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Gm37697-201ENSMUST00000195680 1844 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Npy1r-201ENSMUST00000039303 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Hmg20a-205ENSMUST00000215269 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 6820431F20Rik-201ENSMUST00000150051 936 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Gm5210-201ENSMUST00000182150 1010 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Olfr272-202ENSMUST00000107667 1936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Spns3-201ENSMUST00000021154 1804 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Mpp1-202ENSMUST00000114091 1558 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 3000002C10Rik-201ENSMUST00000125451 1614 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 AC156631.1-201ENSMUST00000215213 1358 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms