Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx2P80206 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx2P80206 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Capn15-204ENSMUST00000212149 4555 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Otx2P80206 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Gm42751-201ENSMUST00000198065 559 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Gm43506-201ENSMUST00000200675 753 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Gm45542-201ENSMUST00000210456 438 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Msh3-202ENSMUST00000185852 3946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Otx2P80206 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Triml2-201ENSMUST00000163869 1467 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Otx2P80206 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Otx2P80206 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Spata16-202ENSMUST00000108305 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Plpbp-203ENSMUST00000209525 5767 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Atp11c-202ENSMUST00000101527 6044 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Gm11957-201ENSMUST00000118304 779 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Gm11475-201ENSMUST00000118482 476 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Gm14052-201ENSMUST00000121434 1031 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Gsta3-202ENSMUST00000121676 894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx2P80206 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx2P80206 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx2P80206 4930402C01Rik-201ENSMUST00000192586 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx2P80206 P4htm-204ENSMUST00000193621 1297 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Gm43460-201ENSMUST00000202491 1057 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Rpl15-ps5-201ENSMUST00000205636 605 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms