Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Otx1P80205 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Otx1P80205 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Otx1P80205 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Otx1P80205 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Otx1P80205 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Otx1P80205 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Otx1P80205 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Otx1P80205 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Otx1P80205 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Otx1P80205 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Otx1P80205 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Otx1P80205 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Otx1P80205 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Otx1P80205 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Otx1P80205 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Otx1P80205 Casc1-208ENSMUST00000204105 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Otx1P80205 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Otx1P80205 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Otx1P80205 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Otx1P80205 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Otx1P80205 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Otx1P80205 4833418N02Rik-201ENSMUST00000137539 1820 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Otx1P80205 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Otx1P80205 Cyp2j13-202ENSMUST00000097973 1648 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Otx1P80205 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Otx1P80205 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Otx1P80205 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Otx1P80205 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Otx1P80205 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Otx1P80205 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Otx1P80205 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Otx1P80205 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Otx1P80205 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Otx1P80205 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Otx1P80205 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Otx1P80205 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Otx1P80205 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Otx1P80205 Gm28693-201ENSMUST00000189622 2638 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Otx1P80205 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Otx1P80205 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Otx1P80205 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Otx1P80205 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Otx1P80205 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Otx1P80205 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Otx1P80205 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Otx1P80205 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Otx1P80205 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Otx1P80205 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Otx1P80205 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Otx1P80205 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Otx1P80205 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Otx1P80205 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Otx1P80205 Gm7255-201ENSMUST00000187371 908 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Otx1P80205 Gm29283-201ENSMUST00000187394 288 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Otx1P80205 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Otx1P80205 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Otx1P80205 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Otx1P80205 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Otx1P80205 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Otx1P80205 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Otx1P80205 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Otx1P80205 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Otx1P80205 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Otx1P80205 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Otx1P80205 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Otx1P80205 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Otx1P80205 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Otx1P80205 Olfr315-202ENSMUST00000203256 2458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Otx1P80205 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Otx1P80205 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Otx1P80205 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Otx1P80205 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Otx1P80205 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Otx1P80205 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Otx1P80205 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Otx1P80205 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Otx1P80205 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Otx1P80205 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Otx1P80205 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Otx1P80205 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Otx1P80205 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Otx1P80205 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Otx1P80205 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Otx1P80205 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Otx1P80205 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Otx1P80205 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Otx1P80205 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Otx1P80205 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Otx1P80205 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Otx1P80205 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Otx1P80205 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Otx1P80205 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Otx1P80205 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Otx1P80205 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Otx1P80205 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Otx1P80205 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Otx1P80205 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Otx1P80205 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Otx1P80205 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms