Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Gpr37-201ENSMUST00000054867 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Tom1l2-203ENSMUST00000093048 4864 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Pcdh15-207ENSMUST00000124046 5336 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Son-204ENSMUST00000119368 7529 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Epb41l5-202ENSMUST00000052404 6442 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
SbdsP70122 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Gm32111-201ENSMUST00000207689 846 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SbdsP70122 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Dopey2-201ENSMUST00000045004 7319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Sall2-201ENSMUST00000058326 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Acot11-202ENSMUST00000102762 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Tmem204-202ENSMUST00000153745 902 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SbdsP70122 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SbdsP70122 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Gm32939-201ENSMUST00000222336 843 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Ciapin1-209ENSMUST00000162538 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SbdsP70122 AC108416.1-201ENSMUST00000228755 1558 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Slco5a1-202ENSMUST00000115403 8509 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Sec16a-201ENSMUST00000091252 8737 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SbdsP70122 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
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