Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Gm8122-201ENSMUST00000165988 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Flna-202ENSMUST00000101454 8345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rps29P62274 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Rnft2-201ENSMUST00000117177 4381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Eapp-202ENSMUST00000110713 886 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Rps29P62274 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rps29P62274 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Gm37988-201ENSMUST00000155020 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Gm16894-201ENSMUST00000181756 842 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Prm2-202ENSMUST00000189593 674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rps29P62274 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Gm44498-201ENSMUST00000199509 111 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Gm36028-202ENSMUST00000205931 1161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rps29P62274 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Rps29P62274 AC164429.1-201ENSMUST00000224210 518 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Rps29P62274 AC164883.7-201ENSMUST00000228534 851 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Ttc24-202ENSMUST00000064550 671 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rps29P62274 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Spty2d1-201ENSMUST00000061639 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rps29P62274 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Krt34-201ENSMUST00000056362 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Atxn1l-202ENSMUST00000212605 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rps29P62274 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Lig3-210ENSMUST00000173347 3631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Cct3-201ENSMUST00000001452 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rps29P62274 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Slco5a1-202ENSMUST00000115403 8509 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Rps29P62274 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Gm12097-201ENSMUST00000121523 1414 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Cage1-203ENSMUST00000110233 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms