Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Arhgap17-202ENSMUST00000106442 3336 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Gramd1b-202ENSMUST00000118159 2781 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Gm37759-201ENSMUST00000194155 3246 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Plekhg5-201ENSMUST00000084115 4113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Colq-205ENSMUST00000150054 2867 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Pif1-201ENSMUST00000047099 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Gm42608-201ENSMUST00000197563 2018 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Tro-201ENSMUST00000087253 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Nfkbiz-204ENSMUST00000114458 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Il20rb-201ENSMUST00000098458 2793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Gm2974-201ENSMUST00000164512 1990 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Gm26822-201ENSMUST00000181732 3374 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 AC117656.2-201ENSMUST00000224931 2215 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Gm30414-201ENSMUST00000194886 2596 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Kif3a-202ENSMUST00000118353 2178 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Duoxa1-203ENSMUST00000110538 2467 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Gm14565-201ENSMUST00000140021 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Ctso-201ENSMUST00000029649 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Dytn-201ENSMUST00000090313 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Gm10425-201ENSMUST00000181085 3364 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 D030055H07Rik-202ENSMUST00000150953 4325 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Gpi1-201ENSMUST00000038027 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Itgad-204ENSMUST00000177111 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Gys1-206ENSMUST00000211150 2681 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Lpin3-203ENSMUST00000109456 3470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Gm26862-201ENSMUST00000181886 2191 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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