Protein–RNA interactions for Protein: P50405

Sftpb, Pulmonary surfactant-associated protein B, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpbP50405 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Lig3-210ENSMUST00000173347 3631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Gpr155-204ENSMUST00000112044 4201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Afap1-201ENSMUST00000064571 6618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Uimc1-204ENSMUST00000127195 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SftpbP50405 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SftpbP50405 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Exoc7-202ENSMUST00000106411 3205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SftpbP50405 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SftpbP50405 C130013H08Rik-201ENSMUST00000197569 3692 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Ptbp3-201ENSMUST00000030076 6855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Pask-201ENSMUST00000027493 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Tom1l2-203ENSMUST00000093048 4864 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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SftpbP50405 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
SftpbP50405 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Cyp2j13-202ENSMUST00000097973 1648 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Usp47-206ENSMUST00000215510 4697 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SftpbP50405 A930007I19Rik-201ENSMUST00000180737 2319 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Lyn-201ENSMUST00000041377 3463 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Atxn7l3-203ENSMUST00000107134 3712 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Phf8-203ENSMUST00000112662 3732 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Morf4l2-212ENSMUST00000164609 1811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Gm38357-201ENSMUST00000195382 2464 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Inpp5b-201ENSMUST00000094782 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Palm2-201ENSMUST00000102904 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Styx-205ENSMUST00000226873 12974 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Tmem204-202ENSMUST00000153745 902 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Gm27441-201ENSMUST00000185000 105 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SftpbP50405 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.2 ms