Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SrprbP47758 F730016J06Rik-201ENSMUST00000126140 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SrprbP47758 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Wdr46-ps-201ENSMUST00000200591 1712 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Atcayos-203ENSMUST00000150782 3057 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Gm5244-201ENSMUST00000164001 339 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Gm7047-201ENSMUST00000196224 1063 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Gm34868-201ENSMUST00000218341 530 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
SrprbP47758 AC116680.1-201ENSMUST00000222804 613 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SrprbP47758 AC134793.1-202ENSMUST00000227444 803 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Hcst-201ENSMUST00000075062 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Stau2-202ENSMUST00000054668 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
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SrprbP47758 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SrprbP47758 AC154528.2-201ENSMUST00000228432 3023 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Gab3-202ENSMUST00000114104 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Gm12829-201ENSMUST00000146346 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
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