Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
RxrgP28705 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RxrgP28705 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Sgcz-201ENSMUST00000118896 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Pla2g4a-201ENSMUST00000070200 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RxrgP28705 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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RxrgP28705 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
RxrgP28705 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RxrgP28705 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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RxrgP28705 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RxrgP28705 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
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