Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Bsdc1-201ENSMUST00000048162 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Slc24a1-201ENSMUST00000037798 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Nkap-201ENSMUST00000016553 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Ptpn21-201ENSMUST00000085116 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Pcdhgc5-201ENSMUST00000055935 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Chd8-201ENSMUST00000089752 8190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Clic5-201ENSMUST00000024755 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Cntnap2-205ENSMUST00000199100 6279 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Gm45597-201ENSMUST00000211524 1994 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 2810032G03Rik-202ENSMUST00000163627 2514 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Wdfy4-202ENSMUST00000130509 10158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Aqr-202ENSMUST00000102543 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Ap1g1-206ENSMUST00000179104 1096 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Trio-210ENSMUST00000227337 6375 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Gm42449-201ENSMUST00000200349 2258 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Tmem126b-201ENSMUST00000032843 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Ntrk3-206ENSMUST00000195262 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Ncoa1-209ENSMUST00000220434 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Agpat3-204ENSMUST00000105389 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Mllt10-201ENSMUST00000028076 4917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Gm44062-201ENSMUST00000203312 4857 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Ano2-204ENSMUST00000160496 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Mkl1-204ENSMUST00000134469 4392 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Zfp532-201ENSMUST00000049016 5503 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Abcc3-201ENSMUST00000021231 4999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Ap5z1-201ENSMUST00000038699 3689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Prdm10-204ENSMUST00000215499 6772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms