Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Plec-208ENSMUST00000080857 14959 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Zfp292-201ENSMUST00000047950 9986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Mllt10-201ENSMUST00000028076 4917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 St6galnac4-201ENSMUST00000102818 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Tanc1-208ENSMUST00000139863 7246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Mab21l3-201ENSMUST00000061831 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Tank-204ENSMUST00000112501 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 AC121574.1-201ENSMUST00000228770 3132 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Wnk4-201ENSMUST00000103108 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Olfr1278-206ENSMUST00000216229 6819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Hnrnpc-201ENSMUST00000111610 2847 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Gcc2-201ENSMUST00000057659 6547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Csf2rb-201ENSMUST00000096355 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Galnt16-201ENSMUST00000021558 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Slc37a2-202ENSMUST00000161114 2945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Clcn1-201ENSMUST00000031894 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Ppip5k1-201ENSMUST00000052029 5533 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Cdk12-201ENSMUST00000003203 4837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Mapk6-202ENSMUST00000168937 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Ap1m2-202ENSMUST00000115433 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Elmo3-201ENSMUST00000109375 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Slc35c1-201ENSMUST00000067631 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Plec-203ENSMUST00000071869 14917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Urb1-203ENSMUST00000140920 7344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Rpp14-201ENSMUST00000023924 2401 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Mcm3-201ENSMUST00000053266 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Igsf9b-204ENSMUST00000214357 16144 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Myo15-201ENSMUST00000071880 11769 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Disp1-202ENSMUST00000171366 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Cir1-201ENSMUST00000058615 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Ptk2b-203ENSMUST00000111121 3365 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Naca-202ENSMUST00000092048 6745 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Cacna1d-207ENSMUST00000224198 6564 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Pde4c-202ENSMUST00000110095 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Ift172-201ENSMUST00000041565 5403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Lhfpl2-201ENSMUST00000054274 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Ank3-206ENSMUST00000092434 5886 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Sh3tc1-207ENSMUST00000201511 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Sall1-201ENSMUST00000034090 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Rnf20-201ENSMUST00000029989 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Zfp521-201ENSMUST00000025288 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms