Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Tmem131l-203ENSMUST00000192095 4774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
TtrP07309 Fhad1-203ENSMUST00000105780 4809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TtrP07309 Pcdh15-226ENSMUST00000151116 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TtrP07309 Synpo2l-203ENSMUST00000119483 3696 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
TtrP07309 Gm43636-201ENSMUST00000201501 2235 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
TtrP07309 Ccdc62-202ENSMUST00000165148 3920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TtrP07309 Fubp1-201ENSMUST00000106121 4525 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TtrP07309 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
TtrP07309 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TtrP07309 Slc35a4-206ENSMUST00000186538 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
TtrP07309 Itgam-207ENSMUST00000098015 4803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
TtrP07309 Gm11131-201ENSMUST00000113886 3122 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
TtrP07309 Ikbkb-201ENSMUST00000033939 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
TtrP07309 Gm23061-201ENSMUST00000102348 116 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
TtrP07309 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
TtrP07309 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TtrP07309 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
TtrP07309 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TtrP07309 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TtrP07309 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
TtrP07309 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
TtrP07309 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
TtrP07309 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
TtrP07309 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
TtrP07309 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
TtrP07309 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TtrP07309 4930478P22Rik-202ENSMUST00000201921 723 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TtrP07309 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
TtrP07309 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
TtrP07309 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
TtrP07309 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
TtrP07309 Gm34868-201ENSMUST00000218341 530 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TtrP07309 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TtrP07309 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
TtrP07309 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TtrP07309 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
TtrP07309 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TtrP07309 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TtrP07309 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TtrP07309 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
TtrP07309 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
TtrP07309 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TtrP07309 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TtrP07309 Apobec3-205ENSMUST00000175752 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
TtrP07309 Gm15271-201ENSMUST00000134627 2110 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TtrP07309 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
TtrP07309 Gm42571-201ENSMUST00000201197 2464 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
TtrP07309 2810032G03Rik-202ENSMUST00000163627 2514 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
TtrP07309 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TtrP07309 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
TtrP07309 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
TtrP07309 Kcng4-201ENSMUST00000061828 3806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
TtrP07309 Pard3-201ENSMUST00000026921 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
TtrP07309 Nkx2-2os-201ENSMUST00000136998 4345 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
TtrP07309 Itga10-201ENSMUST00000029744 5044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TtrP07309 Sulf2-202ENSMUST00000109249 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
TtrP07309 Hmgcll1-201ENSMUST00000008052 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
TtrP07309 Zfp110-201ENSMUST00000004614 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
TtrP07309 Aldh1a3-201ENSMUST00000015278 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
TtrP07309 Specc1-214ENSMUST00000202389 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TtrP07309 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
TtrP07309 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
TtrP07309 Gm44745-201ENSMUST00000206563 2723 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
TtrP07309 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
TtrP07309 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
TtrP07309 Morf4l2-212ENSMUST00000164609 1811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TtrP07309 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
TtrP07309 Olfr243-202ENSMUST00000215723 4735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TtrP07309 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
TtrP07309 4933407K13Rik-203ENSMUST00000138943 4364 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
TtrP07309 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
TtrP07309 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
TtrP07309 Dysf-203ENSMUST00000113818 6571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
TtrP07309 Dhtkd1-201ENSMUST00000026924 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
TtrP07309 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TtrP07309 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
TtrP07309 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TtrP07309 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TtrP07309 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TtrP07309 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
TtrP07309 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
TtrP07309 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TtrP07309 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
TtrP07309 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
TtrP07309 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TtrP07309 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
TtrP07309 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
TtrP07309 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
TtrP07309 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
TtrP07309 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
TtrP07309 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
TtrP07309 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
TtrP07309 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
TtrP07309 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
TtrP07309 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
TtrP07309 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
TtrP07309 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TtrP07309 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TtrP07309 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
TtrP07309 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms