Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Atxn1l-201ENSMUST00000093162 7526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Klhl7-201ENSMUST00000030841 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Atp11c-201ENSMUST00000033480 5939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Arhgap24-204ENSMUST00000112852 2783 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Myc-206ENSMUST00000167731 1821 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
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Ccl20O89093 Gm15264-201ENSMUST00000118050 502 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
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Ccl20O89093 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
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Ccl20O89093 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
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Ccl20O89093 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Hcst-201ENSMUST00000075062 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Srpx2-201ENSMUST00000033606 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Metap1-203ENSMUST00000197531 3708 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 P2ry1-202ENSMUST00000193201 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
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Ccl20O89093 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
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Ccl20O89093 Serac1-202ENSMUST00000097432 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Mtmr7-205ENSMUST00000174205 2679 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Cstf1-201ENSMUST00000116375 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
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Ccl20O89093 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Mpp1-202ENSMUST00000114091 1558 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Ddr1-201ENSMUST00000003628 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Gabrr2-201ENSMUST00000024035 1820 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Tmem154-201ENSMUST00000107682 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 1600014C10Rik-202ENSMUST00000165308 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 1600014C10Rik-204ENSMUST00000178207 3341 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
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