Protein–RNA interactions for Protein: J3QPC3

BC024978, cDNA sequence BC024978, mousemouse

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Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC024978J3QPC3 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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BC024978J3QPC3 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Npy1r-201ENSMUST00000039303 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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BC024978J3QPC3 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Tmem181b-ps-201ENSMUST00000167717 1413 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
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BC024978J3QPC3 Lig3-210ENSMUST00000173347 3631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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BC024978J3QPC3 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Eapp-202ENSMUST00000110713 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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BC024978J3QPC3 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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BC024978J3QPC3 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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BC024978J3QPC3 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
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BC024978J3QPC3 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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BC024978J3QPC3 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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BC024978J3QPC3 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
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BC024978J3QPC3 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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BC024978J3QPC3 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
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