Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Morf4l2-213ENSMUST00000166478 1720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Sepsecs-201ENSMUST00000031069 5252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Gm44510-201ENSMUST00000206288 4532 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Gm13497-201ENSMUST00000139497 2038 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Mblac2-201ENSMUST00000057598 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 C86187-202ENSMUST00000209497 2415 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Bcl9-201ENSMUST00000046521 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Cdh18-203ENSMUST00000164787 2744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Col19a1-201ENSMUST00000051344 3336 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Gm13660-201ENSMUST00000142828 722 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Nutf2-ps1-201ENSMUST00000095978 864 ntAPPRIS P1 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Cd3e-201ENSMUST00000102832 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Olfr169-203ENSMUST00000215476 2476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Mpo-201ENSMUST00000020779 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Tgm4-201ENSMUST00000026893 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Manba-201ENSMUST00000029814 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Ptk2b-201ENSMUST00000022622 4034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Phf21a-205ENSMUST00000111291 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Best3-201ENSMUST00000020378 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Celf2-224ENSMUST00000182879 2223 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Gm43318-201ENSMUST00000199939 1949 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 C330021F23Rik-202ENSMUST00000136592 1621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Zfp536-206ENSMUST00000176205 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Gm43481-201ENSMUST00000201715 3672 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Gm16576-201ENSMUST00000128342 5404 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Olfr1395-203ENSMUST00000214195 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Tnfaip8-212ENSMUST00000179937 2385 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Lrrc8d-202ENSMUST00000120847 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 4930571K23Rik-201ENSMUST00000166958 2153 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Kirrel3-208ENSMUST00000188933 3643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 C78197-201ENSMUST00000152781 3417 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Tmem63a-201ENSMUST00000027800 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Nifk-201ENSMUST00000027626 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Gm38148-201ENSMUST00000195166 3012 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Rpa1-201ENSMUST00000000767 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Piwil4-201ENSMUST00000076946 2637 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Rfx6-202ENSMUST00000122922 3464 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Smad9-201ENSMUST00000029371 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Styk1-201ENSMUST00000049150 3380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Nek11-201ENSMUST00000038648 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 9330175E14Rik-201ENSMUST00000180445 4852 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Pms1-201ENSMUST00000027267 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Ccpg1-202ENSMUST00000085350 2969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Grin2a-201ENSMUST00000032331 4395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Svil-204ENSMUST00000127297 6243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Slf2-201ENSMUST00000096053 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Pcdhb12-201ENSMUST00000055495 3034 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Nrxn1-225ENSMUST00000197268 2280 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Tuba4a-202ENSMUST00000186213 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Smim18J3QNP2 Tacr1-202ENSMUST00000203775 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms