Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Plec-215ENSMUST00000169108 14853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Aqr-202ENSMUST00000102543 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Pole-202ENSMUST00000112481 1523 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Gm38034-201ENSMUST00000193915 2069 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Gm13215-201ENSMUST00000117559 472 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Gm12377-201ENSMUST00000118656 252 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Gm13688-201ENSMUST00000121557 608 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Katnal2-203ENSMUST00000123650 638 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Ppp1r11-203ENSMUST00000174711 520 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Gm17797-201ENSMUST00000182175 997 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Gm30301-201ENSMUST00000199474 652 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Gm9273-201ENSMUST00000200606 715 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Gm43965-201ENSMUST00000203779 789 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Gm45795-201ENSMUST00000211847 400 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Ormdl2-203ENSMUST00000219215 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 AC160931.1-201ENSMUST00000223298 413 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Gm11231-201ENSMUST00000117895 1706 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Ppid-201ENSMUST00000029382 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Palm2-201ENSMUST00000102904 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Spata7-202ENSMUST00000101144 1541 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Psmb3-201ENSMUST00000103147 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Gm11569-201ENSMUST00000105057 869 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Rpl10a-ps1-201ENSMUST00000120360 654 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Tcl1-203ENSMUST00000175652 535 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Gm3383-203ENSMUST00000178414 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Gm3194-201ENSMUST00000180143 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Mir8104-201ENSMUST00000185165 101 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Gm38220-201ENSMUST00000195774 1447 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Olfr139-203ENSMUST00000206280 1059 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Olfr371-202ENSMUST00000218663 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Spata16-202ENSMUST00000108305 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Rasgrp1-204ENSMUST00000173252 1750 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Gm28453-201ENSMUST00000185556 1323 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Nek3-204ENSMUST00000178324 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Apool-201ENSMUST00000026599 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Eif2b3-201ENSMUST00000070610 1369 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Lgals9-203ENSMUST00000108269 1586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Rack1-201ENSMUST00000020640 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Rhox3f-201ENSMUST00000115172 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Zfp740-205ENSMUST00000121206 795 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Gm16288-201ENSMUST00000137940 367 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Rhox3f-203ENSMUST00000184451 1008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Usp9yF8VPU6 Gm39090-201ENSMUST00000205284 972 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms