Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Gab3-202ENSMUST00000114104 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Psmb3-201ENSMUST00000103147 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Mrps36-203ENSMUST00000109333 701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Gm12666-201ENSMUST00000123179 764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Gm6471-202ENSMUST00000148734 587 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Gm8601-201ENSMUST00000182096 909 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Gm7572-201ENSMUST00000182616 766 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Arl14-201ENSMUST00000183126 1200 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Rpl15-ps2-201ENSMUST00000184247 613 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Fgfbp1-203ENSMUST00000199894 1228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Gm31314-201ENSMUST00000201435 609 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Gm45680-201ENSMUST00000211135 214 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 AC101205.2-201ENSMUST00000226206 715 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Gm31138-201ENSMUST00000212296 1705 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Oxsm-201ENSMUST00000022311 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Cyp2d41-ps-201ENSMUST00000180453 1503 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Gm8659-201ENSMUST00000120024 1084 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Gm12950-201ENSMUST00000121683 417 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Gm5860-201ENSMUST00000137810 1028 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Gm24294-201ENSMUST00000158295 277 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Cd9-ps-201ENSMUST00000174687 650 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Gm6291-201ENSMUST00000179994 309 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Gm5976-201ENSMUST00000180794 996 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Gm7765-201ENSMUST00000182585 974 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Gm37688-201ENSMUST00000195195 465 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 AC124613.1-201ENSMUST00000198711 88 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Gm3527-201ENSMUST00000198905 460 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Gm43726-201ENSMUST00000199110 775 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Gm8162-201ENSMUST00000213951 665 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Gm1000-202ENSMUST00000222329 757 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 AC154806.7-201ENSMUST00000227998 202 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Acnat1-201ENSMUST00000095086 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Fanca-202ENSMUST00000118395 3274 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Ino80dos-201ENSMUST00000138611 1576 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Ptgds-203ENSMUST00000114259 775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107 ms