Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vamp5Q9Z2P8 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vamp5Q9Z2P8 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vamp5Q9Z2P8 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vamp5Q9Z2P8 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vamp5Q9Z2P8 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vamp5Q9Z2P8 Fam53b-202ENSMUST00000097998 4341 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vamp5Q9Z2P8 Pkd1l3-203ENSMUST00000212537 6576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vamp5Q9Z2P8 Dgkeos-204ENSMUST00000178493 1902 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vamp5Q9Z2P8 Ccm2-203ENSMUST00000109722 1760 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vamp5Q9Z2P8 Stoml3-201ENSMUST00000029307 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vamp5Q9Z2P8 Pik3c3-202ENSMUST00000115811 3084 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vamp5Q9Z2P8 Rdh16f1-201ENSMUST00000128247 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vamp5Q9Z2P8 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vamp5Q9Z2P8 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Vamp5Q9Z2P8 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Vamp5Q9Z2P8 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Vamp5Q9Z2P8 Capn3-202ENSMUST00000028749 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vamp5Q9Z2P8 4732487G21Rik-201ENSMUST00000181495 2664 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vamp5Q9Z2P8 Gm45170-201ENSMUST00000206746 1671 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Vamp5Q9Z2P8 AC122382.1-201ENSMUST00000225869 2371 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Vamp5Q9Z2P8 N4bp2l1-205ENSMUST00000202031 1864 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vamp5Q9Z2P8 Nudcd3-201ENSMUST00000066496 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vamp5Q9Z2P8 Gm42879-201ENSMUST00000198656 2214 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Vamp5Q9Z2P8 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vamp5Q9Z2P8 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vamp5Q9Z2P8 Ppip5k1-201ENSMUST00000052029 5533 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vamp5Q9Z2P8 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vamp5Q9Z2P8 Cep83os-201ENSMUST00000181906 6566 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vamp5Q9Z2P8 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vamp5Q9Z2P8 Cdyl-201ENSMUST00000075220 3470 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vamp5Q9Z2P8 Atp6v0a4-202ENSMUST00000114908 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vamp5Q9Z2P8 2310002L09Rik-202ENSMUST00000095023 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vamp5Q9Z2P8 Plec-221ENSMUST00000171562 14944 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vamp5Q9Z2P8 Plec-204ENSMUST00000072692 14944 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vamp5Q9Z2P8 Anapc1-203ENSMUST00000110333 4214 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vamp5Q9Z2P8 Prpf8-202ENSMUST00000102510 7249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vamp5Q9Z2P8 Ido2-201ENSMUST00000121992 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vamp5Q9Z2P8 Zfp60-208ENSMUST00000167955 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vamp5Q9Z2P8 Dgkd-201ENSMUST00000027517 5695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vamp5Q9Z2P8 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vamp5Q9Z2P8 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vamp5Q9Z2P8 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vamp5Q9Z2P8 Osbpl5-202ENSMUST00000119499 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vamp5Q9Z2P8 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vamp5Q9Z2P8 Pde10a-211ENSMUST00000149440 4897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vamp5Q9Z2P8 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vamp5Q9Z2P8 Wdr24-201ENSMUST00000026833 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vamp5Q9Z2P8 Zfp418-201ENSMUST00000051435 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vamp5Q9Z2P8 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vamp5Q9Z2P8 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vamp5Q9Z2P8 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vamp5Q9Z2P8 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Vamp5Q9Z2P8 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vamp5Q9Z2P8 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vamp5Q9Z2P8 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vamp5Q9Z2P8 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vamp5Q9Z2P8 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Vamp5Q9Z2P8 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Vamp5Q9Z2P8 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Vamp5Q9Z2P8 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Vamp5Q9Z2P8 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Vamp5Q9Z2P8 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vamp5Q9Z2P8 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vamp5Q9Z2P8 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vamp5Q9Z2P8 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vamp5Q9Z2P8 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vamp5Q9Z2P8 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vamp5Q9Z2P8 Dock7-201ENSMUST00000030286 7127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vamp5Q9Z2P8 Nrp2-201ENSMUST00000027112 4216 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vamp5Q9Z2P8 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vamp5Q9Z2P8 Dpf2-205ENSMUST00000136983 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vamp5Q9Z2P8 Rimbp2-207ENSMUST00000200470 4083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vamp5Q9Z2P8 Sec31b-202ENSMUST00000111985 3548 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vamp5Q9Z2P8 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vamp5Q9Z2P8 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vamp5Q9Z2P8 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vamp5Q9Z2P8 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Vamp5Q9Z2P8 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vamp5Q9Z2P8 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vamp5Q9Z2P8 Rcbtb2-219ENSMUST00000169513 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vamp5Q9Z2P8 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vamp5Q9Z2P8 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vamp5Q9Z2P8 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vamp5Q9Z2P8 Rnf216-201ENSMUST00000053498 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vamp5Q9Z2P8 Uox-201ENSMUST00000029837 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vamp5Q9Z2P8 Gm26947-201ENSMUST00000182497 2929 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vamp5Q9Z2P8 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vamp5Q9Z2P8 Pygm-202ENSMUST00000113483 2583 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vamp5Q9Z2P8 Lrrn4cl-201ENSMUST00000096257 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vamp5Q9Z2P8 Sfmbt1-204ENSMUST00000227303 2960 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Vamp5Q9Z2P8 9230112E08Rik-202ENSMUST00000189441 3352 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Vamp5Q9Z2P8 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vamp5Q9Z2P8 Zfp709-203ENSMUST00000188685 7186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vamp5Q9Z2P8 Adgrl2-213ENSMUST00000199059 4637 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vamp5Q9Z2P8 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Vamp5Q9Z2P8 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vamp5Q9Z2P8 Bbs9-209ENSMUST00000147405 3045 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vamp5Q9Z2P8 Entpd1-204ENSMUST00000134063 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vamp5Q9Z2P8 Gm40634-201ENSMUST00000214129 2001 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms